Protein–RNA interactions for Protein: P32945

PPQ1, Serine/threonine-protein phosphatase PPQ, yeastyeast

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPQ1P32945 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.79□□□□□ -2.54
PPQ1P32945 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.81□□□□□ -2.54
PPQ1P32945 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.83□□□□□ -2.54
PPQ1P32945 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.86□□□□□ -2.55
PPQ1P32945 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.87□□□□□ -2.55
PPQ1P32945 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.87□□□□□ -2.55
PPQ1P32945 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.87□□□□□ -2.55
PPQ1P32945 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.93□□□□□ -2.56
PPQ1P32945 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-0.94□□□□□ -2.56
PPQ1P32945 snR53snR53 91 nt-0.98□□□□□ -2.57
PPQ1P32945 snR6snR6 112 nt-1.01□□□□□ -2.57
PPQ1P32945 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.06□□□□□ -2.58
PPQ1P32945 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.06□□□□□ -2.58
PPQ1P32945 YOR309CYOR309C 381 nt-1.08□□□□□ -2.58
PPQ1P32945 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.14□□□□□ -2.59
PPQ1P32945 YNR077CYNR077C 255 nt-1.14□□□□□ -2.59
PPQ1P32945 snR73snR73 106 nt-1.15□□□□□ -2.59
PPQ1P32945 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.16□□□□□ -2.6
PPQ1P32945 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.35□□□□□ -2.63
PPQ1P32945 snR40snR40 97 nt-1.51□□□□□ -2.65
PPQ1P32945 snR58snR58 96 nt-1.65□□□□□ -2.67
PPQ1P32945 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.65□□□□□ -2.67
PPQ1P32945 snR87snR87 109 nt-1.7□□□□□ -2.68
PPQ1P32945 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.8□□□□□ -2.7
PPQ1P32945 snR75snR75 89 nt-1.85□□□□□ -2.71
PPQ1P32945 YDR543CYDR543C 300 nt-2.18□□□□□ -2.76
PPQ1P32945 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.39□□□□□ -2.79
PPQ1P32945 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.84□□□□□ -2.86
PPQ1P32945 YJR162CYJR162C 351 nt-3.06□□□□□ -2.9
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.9 ms