Protein–RNA interactions for Protein: P28777

ARO2, Chorismate synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARO2P28777 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
ARO2P28777 snR77snR77 88 nt-0.53□□□□□ -2.49
ARO2P28777 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.53□□□□□ -2.49
ARO2P28777 snR53snR53 91 nt-0.55□□□□□ -2.5
ARO2P28777 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.61□□□□□ -2.51
ARO2P28777 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.61□□□□□ -2.51
ARO2P28777 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
ARO2P28777 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.67□□□□□ -2.52
ARO2P28777 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.72□□□□□ -2.52
ARO2P28777 YNR077CYNR077C 255 nt-0.74□□□□□ -2.53
ARO2P28777 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.75□□□□□ -2.53
ARO2P28777 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.82□□□□□ -2.54
ARO2P28777 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.82□□□□□ -2.54
ARO2P28777 snR6snR6 112 nt-0.84□□□□□ -2.54
ARO2P28777 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.84□□□□□ -2.54
ARO2P28777 YOR309CYOR309C 381 nt-0.92□□□□□ -2.56
ARO2P28777 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.94□□□□□ -2.56
ARO2P28777 snR73snR73 106 nt-0.95□□□□□ -2.56
ARO2P28777 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.95□□□□□ -2.56
ARO2P28777 snR40snR40 97 nt-1.06□□□□□ -2.58
ARO2P28777 snR75snR75 89 nt-1.19□□□□□ -2.6
ARO2P28777 snR58snR58 96 nt-1.31□□□□□ -2.62
ARO2P28777 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.36□□□□□ -2.63
ARO2P28777 snR87snR87 109 nt-1.43□□□□□ -2.64
ARO2P28777 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.43□□□□□ -2.64
ARO2P28777 YDR543CYDR543C 300 nt-1.84□□□□□ -2.7
ARO2P28777 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.99□□□□□ -2.73
ARO2P28777 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.44□□□□□ -2.8
ARO2P28777 YJR162CYJR162C 351 nt-2.47□□□□□ -2.8
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