Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms