Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gps1Q99LD4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms