Protein–RNA interactions for Protein: Q99208

YLL066C, Y' element ATP-dependent helicase YLL066C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL066CQ99208 snR52snR52 92 nt0.2□□□□□ -2.38
YLL066CQ99208 SOV1YMR066W 2697 nt0.2□□□□□ -2.38
YLL066CQ99208 YBR099CYBR099C 384 nt0.19□□□□□ -2.38
YLL066CQ99208 snR48snR48 113 nt0.19□□□□□ -2.38
YLL066CQ99208 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.19□□□□□ -2.38
YLL066CQ99208 YDR210WYDR210W 228 nt0.12□□□□□ -2.39
YLL066CQ99208 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.1□□□□□ -2.39
YLL066CQ99208 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.09□□□□□ -2.39
YLL066CQ99208 YJL150WYJL150W 303 nt0.09□□□□□ -2.39
YLL066CQ99208 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.07□□□□□ -2.4
YLL066CQ99208 EST1YLR233C 2100 nt0.06□□□□□ -2.4
YLL066CQ99208 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.05□□□□□ -2.4
YLL066CQ99208 snR39BsnR39B 96 nt0.05□□□□□ -2.4
YLL066CQ99208 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.02□□□□□ -2.41
YLL066CQ99208 YOR102WYOR102W 351 nt0.02□□□□□ -2.41
YLL066CQ99208 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0□□□□□ -2.41
YLL066CQ99208 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.05□□□□□ -2.42
YLL066CQ99208 URB1YKL014C 5295 nt-0.05□□□□□ -2.42
YLL066CQ99208 snR128snR128 126 nt-0.06□□□□□ -2.42
YLL066CQ99208 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.06□□□□□ -2.42
YLL066CQ99208 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.07□□□□□ -2.42
YLL066CQ99208 YNL198CYNL198C 303 nt-0.07□□□□□ -2.42
YLL066CQ99208 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.08□□□□□ -2.42
YLL066CQ99208 snR69snR69 101 nt-0.1□□□□□ -2.43
YLL066CQ99208 YGR164WYGR164W 336 nt-0.1□□□□□ -2.43
YLL066CQ99208 YNL205CYNL205C 423 nt-0.1□□□□□ -2.43
YLL066CQ99208 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.13□□□□□ -2.43
YLL066CQ99208 YNL337WYNL337W 255 nt-0.15□□□□□ -2.43
YLL066CQ99208 RDS3YPR094W 324 nt-0.18□□□□□ -2.44
YLL066CQ99208 MYO1YHR023W 5787 nt-0.18□□□□□ -2.44
YLL066CQ99208 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.19□□□□□ -2.44
YLL066CQ99208 SEC10YLR166C 2616 nt-0.2□□□□□ -2.44
YLL066CQ99208 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.21□□□□□ -2.44
YLL066CQ99208 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.21□□□□□ -2.44
YLL066CQ99208 Q0032Q0032 291 nt-0.23□□□□□ -2.45
YLL066CQ99208 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.23□□□□□ -2.45
YLL066CQ99208 YGR151CYGR151C 336 nt-0.23□□□□□ -2.45
YLL066CQ99208 YBL053WYBL053W 375 nt-0.23□□□□□ -2.45
YLL066CQ99208 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.25□□□□□ -2.45
YLL066CQ99208 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.28□□□□□ -2.45
YLL066CQ99208 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.3□□□□□ -2.46
YLL066CQ99208 SBH2YER019C-A 267 nt-0.3□□□□□ -2.46
YLL066CQ99208 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.34□□□□□ -2.46
YLL066CQ99208 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.35□□□□□ -2.47
YLL066CQ99208 YNL266WYNL266W 420 nt-0.35□□□□□ -2.47
YLL066CQ99208 YNL338WYNL338W 159 nt-0.35□□□□□ -2.47
YLL066CQ99208 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.38□□□□□ -2.47
YLL066CQ99208 YBR178WYBR178W 375 nt-0.38□□□□□ -2.47
YLL066CQ99208 snR50snR50 90 nt-0.39□□□□□ -2.47
YLL066CQ99208 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.43□□□□□ -2.48
YLL066CQ99208 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.44□□□□□ -2.48
YLL066CQ99208 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.45□□□□□ -2.48
YLL066CQ99208 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.5□□□□□ -2.49
YLL066CQ99208 YOR225WYOR225W 330 nt-0.51□□□□□ -2.49
YLL066CQ99208 snR67snR67 82 nt-0.52□□□□□ -2.49
YLL066CQ99208 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.57□□□□□ -2.5
YLL066CQ99208 YNR077CYNR077C 255 nt-0.57□□□□□ -2.5
YLL066CQ99208 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.57□□□□□ -2.5
YLL066CQ99208 SKI7YOR076C 2244 nt-0.65□□□□□ -2.51
YLL066CQ99208 YLR294CYLR294C 330 nt-0.66□□□□□ -2.51
YLL066CQ99208 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.76□□□□□ -2.53
YLL066CQ99208 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.78□□□□□ -2.53
YLL066CQ99208 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
YLL066CQ99208 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
YLL066CQ99208 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
YLL066CQ99208 snR33snR33 183 nt-0.81□□□□□ -2.54
YLL066CQ99208 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.83□□□□□ -2.54
YLL066CQ99208 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.85□□□□□ -2.55
YLL066CQ99208 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.89□□□□□ -2.55
YLL066CQ99208 YNL170WYNL170W 396 nt-0.9□□□□□ -2.55
YLL066CQ99208 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.91□□□□□ -2.55
YLL066CQ99208 snR161snR161 161 nt-0.93□□□□□ -2.56
YLL066CQ99208 snR81snR81 201 nt-0.95□□□□□ -2.56
YLL066CQ99208 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.96□□□□□ -2.56
YLL066CQ99208 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.97□□□□□ -2.57
YLL066CQ99208 ATP8Q0080 147 nt-0.99□□□□□ -2.57
YLL066CQ99208 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.99□□□□□ -2.57
YLL066CQ99208 RPL41AYDL184C 78 nt-1.01□□□□□ -2.57
YLL066CQ99208 snR61snR61 90 nt-1.06□□□□□ -2.58
YLL066CQ99208 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.07□□□□□ -2.58
YLL066CQ99208 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.08□□□□□ -2.58
YLL066CQ99208 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.08□□□□□ -2.58
YLL066CQ99208 snR38snR38 95 nt-1.08□□□□□ -2.58
YLL066CQ99208 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.09□□□□□ -2.58
YLL066CQ99208 snR47snR47 99 nt-1.12□□□□□ -2.59
YLL066CQ99208 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.16□□□□□ -2.59
YLL066CQ99208 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.16□□□□□ -2.59
YLL066CQ99208 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.17□□□□□ -2.6
YLL066CQ99208 Q0092Q0092 141 nt-1.26□□□□□ -2.61
YLL066CQ99208 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.28□□□□□ -2.61
YLL066CQ99208 snR77snR77 88 nt-1.29□□□□□ -2.62
YLL066CQ99208 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.32□□□□□ -2.62
YLL066CQ99208 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.34□□□□□ -2.62
YLL066CQ99208 snR62snR62 100 nt-1.35□□□□□ -2.63
YLL066CQ99208 YKL225WYKL225W 348 nt-1.35□□□□□ -2.63
YLL066CQ99208 Q0143Q0143 153 nt-1.36□□□□□ -2.63
YLL066CQ99208 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.42□□□□□ -2.64
YLL066CQ99208 YMR326CYMR326C 309 nt-1.52□□□□□ -2.65
YLL066CQ99208 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.56□□□□□ -2.66
YLL066CQ99208 YHR217CYHR217C 462 nt-1.6□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms