Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.11□□□□□ -2.23
TRM11Q12463 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.11□□□□□ -2.23
TRM11Q12463 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
TRM11Q12463 RPS26AYGL189C 360 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM11Q12463 SCC2YDR180W 4482 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM11Q12463 snR62snR62 100 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM11Q12463 NST1YNL091W 3723 nt1.09□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 VAM6YDL077C 3150 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 UTP20YBL004W 7482 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 EST1YLR233C 2100 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 CSE1YGL238W 2883 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 YJR029WYJR029W 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.04□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM11Q12463 DOP1YDR141C 5097 nt1.02□□□□□ -2.25
TRM11Q12463 YPR117WYPR117W 7470 nt1.02□□□□□ -2.25
TRM11Q12463 snR69snR69 101 nt1.02□□□□□ -2.25
TRM11Q12463 NIP1YMR309C 2439 nt1□□□□□ -2.25
TRM11Q12463 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1□□□□□ -2.25
TRM11Q12463 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.98□□□□□ -2.25
TRM11Q12463 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM11Q12463 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM11Q12463 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM11Q12463 BUL2YML111W 2763 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM11Q12463 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 RDS3YPR094W 324 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 YMR160WYMR160W 2451 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 YOL014WYOL014W 375 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 snR47snR47 99 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM11Q12463 ORC3YLL004W 1851 nt0.9□□□□□ -2.27
TRM11Q12463 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.89□□□□□ -2.27
TRM11Q12463 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.88□□□□□ -2.27
TRM11Q12463 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.86□□□□□ -2.27
TRM11Q12463 PET111YMR257C 2403 nt0.85□□□□□ -2.27
TRM11Q12463 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.84□□□□□ -2.27
TRM11Q12463 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.84□□□□□ -2.27
TRM11Q12463 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.8□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 LTE1YAL024C 4308 nt0.79□□□□□ -2.28
TRM11Q12463 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.75□□□□□ -2.29
TRM11Q12463 snR50snR50 90 nt0.74□□□□□ -2.29
TRM11Q12463 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.72□□□□□ -2.29
TRM11Q12463 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.72□□□□□ -2.29
TRM11Q12463 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM11Q12463 snR64snR64 101 nt0.67□□□□□ -2.3
TRM11Q12463 RPL41AYDL184C 78 nt0.67□□□□□ -2.3
TRM11Q12463 YKL225WYKL225W 348 nt0.67□□□□□ -2.3
TRM11Q12463 FMP27YLR454W 7887 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM11Q12463 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM11Q12463 snR38snR38 95 nt0.65□□□□□ -2.31
TRM11Q12463 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.64□□□□□ -2.31
TRM11Q12463 AI1Q0050 2505 nt0.63□□□□□ -2.31
TRM11Q12463 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
TRM11Q12463 UTP10YJL109C 5310 nt0.63□□□□□ -2.31
TRM11Q12463 snR53snR53 91 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM11Q12463 MLP1YKR095W 5628 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM11Q12463 snR67snR67 82 nt0.55□□□□□ -2.32
TRM11Q12463 IQG1YPL242C 4488 nt0.55□□□□□ -2.32
TRM11Q12463 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM11Q12463 MLP2YIL149C 5040 nt0.46□□□□□ -2.34
TRM11Q12463 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM11Q12463 THO2YNL139C 4794 nt0.43□□□□□ -2.34
TRM11Q12463 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM11Q12463 SKI7YOR076C 2244 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM11Q12463 SOV1YMR066W 2697 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM11Q12463 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.39□□□□□ -2.35
TRM11Q12463 ESP1YGR098C 4893 nt0.32□□□□□ -2.36
TRM11Q12463 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.32□□□□□ -2.36
TRM11Q12463 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM11Q12463 snR128snR128 126 nt0.27□□□□□ -2.37
TRM11Q12463 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.26□□□□□ -2.37
TRM11Q12463 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.24□□□□□ -2.37
TRM11Q12463 PAU9YBL108C-A 129 nt0.15□□□□□ -2.39
TRM11Q12463 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.13□□□□□ -2.39
TRM11Q12463 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.06□□□□□ -2.4
TRM11Q12463 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.05□□□□□ -2.4
TRM11Q12463 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.01□□□□□ -2.41
TRM11Q12463 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.01□□□□□ -2.41
TRM11Q12463 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0□□□□□ -2.41
TRM11Q12463 SBH2YER019C-A 267 nt-0.08□□□□□ -2.42
TRM11Q12463 snR77snR77 88 nt-0.1□□□□□ -2.43
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