Protein–RNA interactions for Protein: Q12432

EAF3, Chromatin modification-related protein EAF3, yeastyeast

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EAF3Q12432 YBR099CYBR099C 384 nt0.2□□□□□ -2.38
EAF3Q12432 UTP20YBL004W 7482 nt0.19□□□□□ -2.38
EAF3Q12432 snR39BsnR39B 96 nt0.19□□□□□ -2.38
EAF3Q12432 SOV1YMR066W 2697 nt0.18□□□□□ -2.38
EAF3Q12432 YOL014WYOL014W 375 nt0.18□□□□□ -2.38
EAF3Q12432 AI1Q0050 2505 nt0.17□□□□□ -2.38
EAF3Q12432 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.17□□□□□ -2.38
EAF3Q12432 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.15□□□□□ -2.39
EAF3Q12432 QCR9YGR183C 201 nt0.15□□□□□ -2.39
EAF3Q12432 YOR102WYOR102W 351 nt0.13□□□□□ -2.39
EAF3Q12432 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.11□□□□□ -2.39
EAF3Q12432 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.11□□□□□ -2.39
EAF3Q12432 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.11□□□□□ -2.39
EAF3Q12432 YNL198CYNL198C 303 nt0.11□□□□□ -2.39
EAF3Q12432 EST1YLR233C 2100 nt0.1□□□□□ -2.39
EAF3Q12432 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.08□□□□□ -2.4
EAF3Q12432 YBL053WYBL053W 375 nt0.08□□□□□ -2.4
EAF3Q12432 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.05□□□□□ -2.4
EAF3Q12432 YGR151CYGR151C 336 nt0.02□□□□□ -2.41
EAF3Q12432 YNL337WYNL337W 255 nt0.02□□□□□ -2.41
EAF3Q12432 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.01□□□□□ -2.41
EAF3Q12432 snR69snR69 101 nt0□□□□□ -2.41
EAF3Q12432 YER078W-AYER078W-A 165 nt0□□□□□ -2.41
EAF3Q12432 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.01□□□□□ -2.41
EAF3Q12432 YGR164WYGR164W 336 nt-0.02□□□□□ -2.41
EAF3Q12432 snR128snR128 126 nt-0.02□□□□□ -2.41
EAF3Q12432 YNL205CYNL205C 423 nt-0.03□□□□□ -2.41
EAF3Q12432 YNL338WYNL338W 159 nt-0.06□□□□□ -2.42
EAF3Q12432 Q0032Q0032 291 nt-0.09□□□□□ -2.42
EAF3Q12432 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.09□□□□□ -2.42
EAF3Q12432 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.09□□□□□ -2.42
EAF3Q12432 RDS3YPR094W 324 nt-0.1□□□□□ -2.43
EAF3Q12432 snR45snR45 172 nt-0.1□□□□□ -2.43
EAF3Q12432 SEC10YLR166C 2616 nt-0.1□□□□□ -2.43
EAF3Q12432 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.13□□□□□ -2.43
EAF3Q12432 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.15□□□□□ -2.43
EAF3Q12432 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.16□□□□□ -2.44
EAF3Q12432 YBR178WYBR178W 375 nt-0.17□□□□□ -2.44
EAF3Q12432 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.18□□□□□ -2.44
EAF3Q12432 SBH2YER019C-A 267 nt-0.18□□□□□ -2.44
EAF3Q12432 YNL266WYNL266W 420 nt-0.18□□□□□ -2.44
EAF3Q12432 snR50snR50 90 nt-0.18□□□□□ -2.44
EAF3Q12432 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.2□□□□□ -2.44
EAF3Q12432 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.21□□□□□ -2.44
EAF3Q12432 YOR225WYOR225W 330 nt-0.21□□□□□ -2.44
EAF3Q12432 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.22□□□□□ -2.44
EAF3Q12432 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.24□□□□□ -2.45
EAF3Q12432 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.25□□□□□ -2.45
EAF3Q12432 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.26□□□□□ -2.45
EAF3Q12432 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.27□□□□□ -2.45
EAF3Q12432 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.27□□□□□ -2.45
EAF3Q12432 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.29□□□□□ -2.46
EAF3Q12432 YLR294CYLR294C 330 nt-0.32□□□□□ -2.46
EAF3Q12432 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.33□□□□□ -2.46
EAF3Q12432 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.34□□□□□ -2.46
EAF3Q12432 snR67snR67 82 nt-0.37□□□□□ -2.47
EAF3Q12432 SKI7YOR076C 2244 nt-0.38□□□□□ -2.47
EAF3Q12432 snR33snR33 183 nt-0.38□□□□□ -2.47
EAF3Q12432 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.41□□□□□ -2.48
EAF3Q12432 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.41□□□□□ -2.48
EAF3Q12432 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.41□□□□□ -2.48
EAF3Q12432 URB1YKL014C 5295 nt-0.45□□□□□ -2.48
EAF3Q12432 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.45□□□□□ -2.48
EAF3Q12432 snR161snR161 161 nt-0.46□□□□□ -2.48
EAF3Q12432 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.47□□□□□ -2.48
EAF3Q12432 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.55□□□□□ -2.5
EAF3Q12432 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.57□□□□□ -2.5
EAF3Q12432 YNL170WYNL170W 396 nt-0.57□□□□□ -2.5
EAF3Q12432 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.57□□□□□ -2.5
EAF3Q12432 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.58□□□□□ -2.5
EAF3Q12432 snR77snR77 88 nt-0.61□□□□□ -2.51
EAF3Q12432 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.61□□□□□ -2.51
EAF3Q12432 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.63□□□□□ -2.51
EAF3Q12432 snR81snR81 201 nt-0.64□□□□□ -2.51
EAF3Q12432 ATP8Q0080 147 nt-0.64□□□□□ -2.51
EAF3Q12432 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.66□□□□□ -2.52
EAF3Q12432 snR38snR38 95 nt-0.66□□□□□ -2.52
EAF3Q12432 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
EAF3Q12432 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.67□□□□□ -2.52
EAF3Q12432 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.69□□□□□ -2.52
EAF3Q12432 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.71□□□□□ -2.52
EAF3Q12432 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.72□□□□□ -2.52
EAF3Q12432 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.74□□□□□ -2.53
EAF3Q12432 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.74□□□□□ -2.53
EAF3Q12432 snR47snR47 99 nt-0.75□□□□□ -2.53
EAF3Q12432 snR61snR61 90 nt-0.76□□□□□ -2.53
EAF3Q12432 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.76□□□□□ -2.53
EAF3Q12432 RPL41AYDL184C 78 nt-0.77□□□□□ -2.53
EAF3Q12432 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.78□□□□□ -2.53
EAF3Q12432 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.79□□□□□ -2.54
EAF3Q12432 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.8□□□□□ -2.54
EAF3Q12432 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.82□□□□□ -2.54
EAF3Q12432 YOR309CYOR309C 381 nt-0.83□□□□□ -2.54
EAF3Q12432 Q0092Q0092 141 nt-0.84□□□□□ -2.54
EAF3Q12432 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.85□□□□□ -2.55
EAF3Q12432 YKL225WYKL225W 348 nt-0.95□□□□□ -2.56
EAF3Q12432 snR6snR6 112 nt-0.97□□□□□ -2.56
EAF3Q12432 Q0143Q0143 153 nt-0.97□□□□□ -2.56
EAF3Q12432 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.99□□□□□ -2.57
EAF3Q12432 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.02□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms