Protein–RNA interactions for Protein: Q12402

YOP1, Protein YOP1, yeastyeast

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOP1Q12402 YJL150WYJL150W 303 nt-0.1□□□□□ -2.43
YOP1Q12402 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.11□□□□□ -2.43
YOP1Q12402 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.12□□□□□ -2.43
YOP1Q12402 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-0.13□□□□□ -2.43
YOP1Q12402 YGR164WYGR164W 336 nt-0.13□□□□□ -2.43
YOP1Q12402 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.15□□□□□ -2.43
YOP1Q12402 snR69snR69 101 nt-0.15□□□□□ -2.43
YOP1Q12402 YOR102WYOR102W 351 nt-0.15□□□□□ -2.43
YOP1Q12402 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.19□□□□□ -2.44
YOP1Q12402 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.19□□□□□ -2.44
YOP1Q12402 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.21□□□□□ -2.44
YOP1Q12402 YNL198CYNL198C 303 nt-0.23□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 YNL205CYNL205C 423 nt-0.24□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.25□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.25□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.25□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.25□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.25□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.25□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.25□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.25□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 RDS3YPR094W 324 nt-0.25□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 snR45snR45 172 nt-0.25□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.28□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.28□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 YBL053WYBL053W 375 nt-0.28□□□□□ -2.45
YOP1Q12402 SBH2YER019C-A 267 nt-0.3□□□□□ -2.46
YOP1Q12402 SEC10YLR166C 2616 nt-0.3□□□□□ -2.46
YOP1Q12402 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.32□□□□□ -2.46
YOP1Q12402 STF2YGR008C 255 nt-0.32□□□□□ -2.46
YOP1Q12402 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.33□□□□□ -2.46
YOP1Q12402 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.35□□□□□ -2.47
YOP1Q12402 YOL014WYOL014W 375 nt-0.35□□□□□ -2.47
YOP1Q12402 YBR178WYBR178W 375 nt-0.36□□□□□ -2.47
YOP1Q12402 snR50snR50 90 nt-0.36□□□□□ -2.47
YOP1Q12402 YGR151CYGR151C 336 nt-0.38□□□□□ -2.47
YOP1Q12402 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.38□□□□□ -2.47
YOP1Q12402 YNL266WYNL266W 420 nt-0.38□□□□□ -2.47
YOP1Q12402 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.4□□□□□ -2.47
YOP1Q12402 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.44□□□□□ -2.48
YOP1Q12402 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.46□□□□□ -2.48
YOP1Q12402 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.46□□□□□ -2.48
YOP1Q12402 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.47□□□□□ -2.48
YOP1Q12402 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.47□□□□□ -2.48
YOP1Q12402 YNL337WYNL337W 255 nt-0.48□□□□□ -2.49
YOP1Q12402 YNL338WYNL338W 159 nt-0.49□□□□□ -2.49
YOP1Q12402 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.5□□□□□ -2.49
YOP1Q12402 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.51□□□□□ -2.49
YOP1Q12402 snR67snR67 82 nt-0.53□□□□□ -2.49
YOP1Q12402 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.54□□□□□ -2.5
YOP1Q12402 URB1YKL014C 5295 nt-0.57□□□□□ -2.5
YOP1Q12402 Q0032Q0032 291 nt-0.59□□□□□ -2.5
YOP1Q12402 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.64□□□□□ -2.51
YOP1Q12402 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.66□□□□□ -2.52
YOP1Q12402 SKI7YOR076C 2244 nt-0.67□□□□□ -2.52
YOP1Q12402 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.73□□□□□ -2.53
YOP1Q12402 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.75□□□□□ -2.53
YOP1Q12402 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.78□□□□□ -2.53
YOP1Q12402 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.8□□□□□ -2.54
YOP1Q12402 snR33snR33 183 nt-0.84□□□□□ -2.54
YOP1Q12402 YOR225WYOR225W 330 nt-0.85□□□□□ -2.55
YOP1Q12402 snR161snR161 161 nt-0.85□□□□□ -2.55
YOP1Q12402 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.88□□□□□ -2.55
YOP1Q12402 YLR294CYLR294C 330 nt-0.89□□□□□ -2.55
YOP1Q12402 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.92□□□□□ -2.56
YOP1Q12402 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.95□□□□□ -2.56
YOP1Q12402 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1□□□□□ -2.57
YOP1Q12402 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.01□□□□□ -2.57
YOP1Q12402 snR81snR81 201 nt-1.02□□□□□ -2.57
YOP1Q12402 RPL41AYDL184C 78 nt-1.03□□□□□ -2.57
YOP1Q12402 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.03□□□□□ -2.57
YOP1Q12402 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
YOP1Q12402 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
YOP1Q12402 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
YOP1Q12402 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.06□□□□□ -2.58
YOP1Q12402 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.1□□□□□ -2.59
YOP1Q12402 YNL170WYNL170W 396 nt-1.11□□□□□ -2.59
YOP1Q12402 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.12□□□□□ -2.59
YOP1Q12402 snR47snR47 99 nt-1.12□□□□□ -2.59
YOP1Q12402 snR38snR38 95 nt-1.13□□□□□ -2.59
YOP1Q12402 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.14□□□□□ -2.59
YOP1Q12402 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.17□□□□□ -2.6
YOP1Q12402 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.19□□□□□ -2.6
YOP1Q12402 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.19□□□□□ -2.6
YOP1Q12402 snR61snR61 90 nt-1.2□□□□□ -2.6
YOP1Q12402 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.21□□□□□ -2.6
YOP1Q12402 ATP8Q0080 147 nt-1.24□□□□□ -2.61
YOP1Q12402 snR77snR77 88 nt-1.25□□□□□ -2.61
YOP1Q12402 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.26□□□□□ -2.61
YOP1Q12402 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.32□□□□□ -2.62
YOP1Q12402 YKL225WYKL225W 348 nt-1.38□□□□□ -2.63
YOP1Q12402 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.43□□□□□ -2.64
YOP1Q12402 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.44□□□□□ -2.64
YOP1Q12402 snR62snR62 100 nt-1.45□□□□□ -2.64
YOP1Q12402 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.45□□□□□ -2.64
YOP1Q12402 Q0092Q0092 141 nt-1.49□□□□□ -2.65
YOP1Q12402 Q0143Q0143 153 nt-1.57□□□□□ -2.66
YOP1Q12402 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.61□□□□□ -2.67
YOP1Q12402 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.69□□□□□ -2.68
YOP1Q12402 YMR326CYMR326C 309 nt-1.71□□□□□ -2.68
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