Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.31□□□□□ -2.46
RIO1Q12196 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.31□□□□□ -2.46
RIO1Q12196 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.31□□□□□ -2.46
RIO1Q12196 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.32□□□□□ -2.46
RIO1Q12196 snR52snR52 92 nt-0.32□□□□□ -2.46
RIO1Q12196 YOR170WYOR170W 306 nt-0.33□□□□□ -2.46
RIO1Q12196 snR69snR69 101 nt-0.34□□□□□ -2.46
RIO1Q12196 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.35□□□□□ -2.47
RIO1Q12196 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.35□□□□□ -2.47
RIO1Q12196 snR50snR50 90 nt-0.36□□□□□ -2.47
RIO1Q12196 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.37□□□□□ -2.47
RIO1Q12196 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.37□□□□□ -2.47
RIO1Q12196 JLP2YMR132C 627 nt-0.38□□□□□ -2.47
RIO1Q12196 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.4□□□□□ -2.47
RIO1Q12196 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.4□□□□□ -2.47
RIO1Q12196 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.4□□□□□ -2.47
RIO1Q12196 snR46snR46 197 nt-0.4□□□□□ -2.47
RIO1Q12196 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.41□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 YNL266WYNL266W 420 nt-0.41□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.42□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.43□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 SEC10YLR166C 2616 nt-0.44□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 Q0142Q0142 177 nt-0.44□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 RDS3YPR094W 324 nt-0.44□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.45□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.45□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 YBR178WYBR178W 375 nt-0.46□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 snR48snR48 113 nt-0.46□□□□□ -2.48
RIO1Q12196 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.48□□□□□ -2.49
RIO1Q12196 YBL053WYBL053W 375 nt-0.48□□□□□ -2.49
RIO1Q12196 YNL198CYNL198C 303 nt-0.51□□□□□ -2.49
RIO1Q12196 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.52□□□□□ -2.49
RIO1Q12196 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.52□□□□□ -2.49
RIO1Q12196 YOR102WYOR102W 351 nt-0.52□□□□□ -2.49
RIO1Q12196 YJL150WYJL150W 303 nt-0.53□□□□□ -2.49
RIO1Q12196 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.54□□□□□ -2.5
RIO1Q12196 YNL205CYNL205C 423 nt-0.54□□□□□ -2.5
RIO1Q12196 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.55□□□□□ -2.5
RIO1Q12196 URB1YKL014C 5295 nt-0.55□□□□□ -2.5
RIO1Q12196 RPM2YML091C 3609 nt-0.56□□□□□ -2.5
RIO1Q12196 SKI7YOR076C 2244 nt-0.58□□□□□ -2.5
RIO1Q12196 snR67snR67 82 nt-0.6□□□□□ -2.51
RIO1Q12196 snR33snR33 183 nt-0.6□□□□□ -2.51
RIO1Q12196 SPG3YDR504C 384 nt-0.66□□□□□ -2.52
RIO1Q12196 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.66□□□□□ -2.52
RIO1Q12196 snR161snR161 161 nt-0.67□□□□□ -2.52
RIO1Q12196 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.68□□□□□ -2.52
RIO1Q12196 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.69□□□□□ -2.52
RIO1Q12196 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.69□□□□□ -2.52
RIO1Q12196 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.69□□□□□ -2.52
RIO1Q12196 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.73□□□□□ -2.53
RIO1Q12196 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.73□□□□□ -2.53
RIO1Q12196 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-0.75□□□□□ -2.53
RIO1Q12196 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
RIO1Q12196 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.82□□□□□ -2.54
RIO1Q12196 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.83□□□□□ -2.54
RIO1Q12196 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.84□□□□□ -2.54
RIO1Q12196 YNL338WYNL338W 159 nt-0.84□□□□□ -2.54
RIO1Q12196 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.85□□□□□ -2.55
RIO1Q12196 YGR151CYGR151C 336 nt-0.87□□□□□ -2.55
RIO1Q12196 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.87□□□□□ -2.55
RIO1Q12196 snR77snR77 88 nt-0.88□□□□□ -2.55
RIO1Q12196 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.89□□□□□ -2.55
RIO1Q12196 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-0.9□□□□□ -2.55
RIO1Q12196 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.91□□□□□ -2.56
RIO1Q12196 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.94□□□□□ -2.56
RIO1Q12196 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.95□□□□□ -2.56
RIO1Q12196 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.96□□□□□ -2.56
RIO1Q12196 snR38snR38 95 nt-1□□□□□ -2.57
RIO1Q12196 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.01□□□□□ -2.57
RIO1Q12196 RPL41AYDL184C 78 nt-1.02□□□□□ -2.57
RIO1Q12196 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.02□□□□□ -2.57
RIO1Q12196 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.02□□□□□ -2.57
RIO1Q12196 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.04□□□□□ -2.58
RIO1Q12196 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.05□□□□□ -2.58
RIO1Q12196 snR47snR47 99 nt-1.05□□□□□ -2.58
RIO1Q12196 snR81snR81 201 nt-1.08□□□□□ -2.58
RIO1Q12196 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.08□□□□□ -2.58
RIO1Q12196 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.1□□□□□ -2.59
RIO1Q12196 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.11□□□□□ -2.59
RIO1Q12196 YNL337WYNL337W 255 nt-1.13□□□□□ -2.59
RIO1Q12196 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.15□□□□□ -2.59
RIO1Q12196 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.16□□□□□ -2.6
RIO1Q12196 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-1.19□□□□□ -2.6
RIO1Q12196 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.23□□□□□ -2.61
RIO1Q12196 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.23□□□□□ -2.61
RIO1Q12196 Q0032Q0032 291 nt-1.24□□□□□ -2.61
RIO1Q12196 YOR309CYOR309C 381 nt-1.26□□□□□ -2.61
RIO1Q12196 YKL225WYKL225W 348 nt-1.27□□□□□ -2.61
RIO1Q12196 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.28□□□□□ -2.61
RIO1Q12196 snR6snR6 112 nt-1.36□□□□□ -2.63
RIO1Q12196 YLR294CYLR294C 330 nt-1.36□□□□□ -2.63
RIO1Q12196 YNL170WYNL170W 396 nt-1.36□□□□□ -2.63
RIO1Q12196 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.37□□□□□ -2.63
RIO1Q12196 snR61snR61 90 nt-1.38□□□□□ -2.63
RIO1Q12196 YNR077CYNR077C 255 nt-1.38□□□□□ -2.63
RIO1Q12196 YOR225WYOR225W 330 nt-1.38□□□□□ -2.63
RIO1Q12196 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.42□□□□□ -2.64
RIO1Q12196 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.42□□□□□ -2.64
RIO1Q12196 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.44□□□□□ -2.64
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