Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
TY3A-G	Q12173	TFB5	YDR079C-A	219 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
TY3A-G	Q12173	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
TY3A-G	Q12173	YJL150W	YJL150W	303 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
TY3A-G	Q12173	YBL053W	YBL053W	375 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
TY3A-G	Q12173	snR48	snR48	113 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
TY3A-G	Q12173	YGR164W	YGR164W	336 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
TY3A-G	Q12173	snR128	snR128	126 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
TY3A-G	Q12173	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
TY3A-G	Q12173	JLP2	YMR132C	627 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
TY3A-G	Q12173	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
TY3A-G	Q12173	snR69	snR69	101 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
TY3A-G	Q12173	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
TY3A-G	Q12173	SPG3	YDR504C	384 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
TY3A-G	Q12173	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
TY3A-G	Q12173	YNL198C	YNL198C	303 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
TY3A-G	Q12173	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
TY3A-G	Q12173	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
TY3A-G	Q12173	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
TY3A-G	Q12173	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
TY3A-G	Q12173	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
TY3A-G	Q12173	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
TY3A-G	Q12173	YOR102W	YOR102W	351 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
TY3A-G	Q12173	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
TY3A-G	Q12173	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
TY3A-G	Q12173	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
TY3A-G	Q12173	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
TY3A-G	Q12173	snR50	snR50	90 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
TY3A-G	Q12173	YNL266W	YNL266W	420 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
TY3A-G	Q12173	RDS3	YPR094W	324 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
TY3A-G	Q12173	SEC10	YLR166C	2616 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
TY3A-G	Q12173	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
TY3A-G	Q12173	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
TY3A-G	Q12173	YBR178W	YBR178W	375 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
TY3A-G	Q12173	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
TY3A-G	Q12173	YNL205C	YNL205C	423 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
TY3A-G	Q12173	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-0.32	□□□□□ -2.46
TY3A-G	Q12173	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
TY3A-G	Q12173	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
TY3A-G	Q12173	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
TY3A-G	Q12173	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
TY3A-G	Q12173	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
TY3A-G	Q12173	YGR151C	YGR151C	336 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
TY3A-G	Q12173	YNL338W	YNL338W	159 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
TY3A-G	Q12173	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
TY3A-G	Q12173	SKI7	YOR076C	2244 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
TY3A-G	Q12173	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
TY3A-G	Q12173	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
TY3A-G	Q12173	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
TY3A-G	Q12173	snR67	snR67	82 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
TY3A-G	Q12173	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
TY3A-G	Q12173	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
TY3A-G	Q12173	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
TY3A-G	Q12173	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
TY3A-G	Q12173	YNL337W	YNL337W	255 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
TY3A-G	Q12173	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
TY3A-G	Q12173	snR33	snR33	183 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
TY3A-G	Q12173	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.6	□□□□□ -2.5
TY3A-G	Q12173	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
TY3A-G	Q12173	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
TY3A-G	Q12173	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
TY3A-G	Q12173	YNR077C	YNR077C	255 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
TY3A-G	Q12173	Q0032	Q0032	291 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
TY3A-G	Q12173	YOR225W	YOR225W	330 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
TY3A-G	Q12173	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
TY3A-G	Q12173	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
TY3A-G	Q12173	snR161	snR161	161 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
TY3A-G	Q12173	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
TY3A-G	Q12173	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
TY3A-G	Q12173	YLR294C	YLR294C	330 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
TY3A-G	Q12173	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
TY3A-G	Q12173	snR81	snR81	201 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
TY3A-G	Q12173	snR38	snR38	95 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
TY3A-G	Q12173	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
TY3A-G	Q12173	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
TY3A-G	Q12173	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
TY3A-G	Q12173	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
TY3A-G	Q12173	snR77	snR77	88 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
TY3A-G	Q12173	RPL41A	YDL184C	78 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
TY3A-G	Q12173	snR47	snR47	99 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
TY3A-G	Q12173	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
TY3A-G	Q12173	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
TY3A-G	Q12173	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
TY3A-G	Q12173	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
TY3A-G	Q12173	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
TY3A-G	Q12173	YNL170W	YNL170W	396 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
TY3A-G	Q12173	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
TY3A-G	Q12173	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
TY3A-G	Q12173	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
TY3A-G	Q12173	snR61	snR61	90 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
TY3A-G	Q12173	ATP8	Q0080	147 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
TY3A-G	Q12173	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
TY3A-G	Q12173	YKL225W	YKL225W	348 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
TY3A-G	Q12173	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
TY3A-G	Q12173	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
TY3A-G	Q12173	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
TY3A-G	Q12173	snR62	snR62	100 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
TY3A-G	Q12173	Q0092	Q0092	141 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
TY3A-G	Q12173	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
TY3A-G	Q12173	Q0143	Q0143	153 nt		-1.23	□□□□□ -2.61

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