Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.09□□□□□ -2.24
YLR225CQ05948 SEC10YLR166C 2616 nt1.08□□□□□ -2.24
YLR225CQ05948 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.08□□□□□ -2.24
YLR225CQ05948 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.07□□□□□ -2.24
YLR225CQ05948 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.06□□□□□ -2.24
YLR225CQ05948 CSE1YGL238W 2883 nt1.04□□□□□ -2.24
YLR225CQ05948 snR81snR81 201 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 NIP1YMR309C 2439 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 YJR029WYJR029W 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 BUL2YML111W 2763 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 RKR1YMR247C 4689 nt1.01□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 MLP1YKR095W 5628 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 IQG1YPL242C 4488 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 snR69snR69 101 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR225CQ05948 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.96□□□□□ -2.26
YLR225CQ05948 PET111YMR257C 2403 nt0.96□□□□□ -2.26
YLR225CQ05948 EST1YLR233C 2100 nt0.94□□□□□ -2.26
YLR225CQ05948 BEM2YER155C 6504 nt0.93□□□□□ -2.26
YLR225CQ05948 RPS26AYGL189C 360 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR225CQ05948 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR225CQ05948 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.91□□□□□ -2.26
YLR225CQ05948 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.91□□□□□ -2.26
YLR225CQ05948 RDS3YPR094W 324 nt0.91□□□□□ -2.26
YLR225CQ05948 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.89□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.88□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.87□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR225CQ05948 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.83□□□□□ -2.28
YLR225CQ05948 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.83□□□□□ -2.28
YLR225CQ05948 snR62snR62 100 nt0.81□□□□□ -2.28
YLR225CQ05948 AI1Q0050 2505 nt0.81□□□□□ -2.28
YLR225CQ05948 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.77□□□□□ -2.29
YLR225CQ05948 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.76□□□□□ -2.29
YLR225CQ05948 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.76□□□□□ -2.29
YLR225CQ05948 ORC3YLL004W 1851 nt0.75□□□□□ -2.29
YLR225CQ05948 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.75□□□□□ -2.29
YLR225CQ05948 MLP2YIL149C 5040 nt0.75□□□□□ -2.29
YLR225CQ05948 FMP27YLR454W 7887 nt0.75□□□□□ -2.29
YLR225CQ05948 THO2YNL139C 4794 nt0.74□□□□□ -2.29
YLR225CQ05948 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.71□□□□□ -2.3
YLR225CQ05948 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.71□□□□□ -2.3
YLR225CQ05948 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.7□□□□□ -2.3
YLR225CQ05948 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.66□□□□□ -2.3
YLR225CQ05948 snR45snR45 172 nt0.66□□□□□ -2.3
YLR225CQ05948 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.64□□□□□ -2.31
YLR225CQ05948 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
YLR225CQ05948 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.61□□□□□ -2.31
YLR225CQ05948 snR47snR47 99 nt0.6□□□□□ -2.31
YLR225CQ05948 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.59□□□□□ -2.31
YLR225CQ05948 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR225CQ05948 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
YLR225CQ05948 MYO1YHR023W 5787 nt0.56□□□□□ -2.32
YLR225CQ05948 snR50snR50 90 nt0.55□□□□□ -2.32
YLR225CQ05948 snR67snR67 82 nt0.48□□□□□ -2.33
YLR225CQ05948 RPL41AYDL184C 78 nt0.46□□□□□ -2.34
YLR225CQ05948 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.46□□□□□ -2.34
YLR225CQ05948 ESP1YGR098C 4893 nt0.44□□□□□ -2.34
YLR225CQ05948 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.43□□□□□ -2.34
YLR225CQ05948 SOV1YMR066W 2697 nt0.4□□□□□ -2.35
YLR225CQ05948 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.38□□□□□ -2.35
YLR225CQ05948 YKL225WYKL225W 348 nt0.34□□□□□ -2.36
YLR225CQ05948 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.34□□□□□ -2.36
YLR225CQ05948 snR64snR64 101 nt0.3□□□□□ -2.36
YLR225CQ05948 snR38snR38 95 nt0.28□□□□□ -2.36
YLR225CQ05948 snR128snR128 126 nt0.27□□□□□ -2.37
YLR225CQ05948 snR53snR53 91 nt0.21□□□□□ -2.38
YLR225CQ05948 SKI7YOR076C 2244 nt0.14□□□□□ -2.39
YLR225CQ05948 PAU9YBL108C-A 129 nt0.04□□□□□ -2.4
YLR225CQ05948 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.02□□□□□ -2.41
YLR225CQ05948 YJL113WYJL113W 4647 nt0.01□□□□□ -2.41
YLR225CQ05948 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.08□□□□□ -2.42
YLR225CQ05948 SBH2YER019C-A 267 nt-0.1□□□□□ -2.43
YLR225CQ05948 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.1□□□□□ -2.43
YLR225CQ05948 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.11□□□□□ -2.43
YLR225CQ05948 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.17□□□□□ -2.44
YLR225CQ05948 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.21□□□□□ -2.44
YLR225CQ05948 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.28□□□□□ -2.45
YLR225CQ05948 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.3□□□□□ -2.46
YLR225CQ05948 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.3□□□□□ -2.46
YLR225CQ05948 snR161snR161 161 nt-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.3 ms