Protein–RNA interactions for Protein: Q05899

YLR297W, Uncharacterized vacuolar protein YLR297W, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR297WQ05899 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.66□□□□□ -2.52
YLR297WQ05899 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.66□□□□□ -2.52
YLR297WQ05899 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.67□□□□□ -2.52
YLR297WQ05899 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.69□□□□□ -2.52
YLR297WQ05899 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.71□□□□□ -2.52
YLR297WQ05899 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.73□□□□□ -2.53
YLR297WQ05899 snR69snR69 101 nt-0.74□□□□□ -2.53
YLR297WQ05899 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.74□□□□□ -2.53
YLR297WQ05899 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.75□□□□□ -2.53
YLR297WQ05899 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.76□□□□□ -2.53
YLR297WQ05899 YOR302WYOR302W 78 nt-0.76□□□□□ -2.53
YLR297WQ05899 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.79□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.79□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 snR39BsnR39B 96 nt-0.79□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.82□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.83□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.83□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.84□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.84□□□□□ -2.54
YLR297WQ05899 RDS3YPR094W 324 nt-0.85□□□□□ -2.55
YLR297WQ05899 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.86□□□□□ -2.55
YLR297WQ05899 snR33snR33 183 nt-0.88□□□□□ -2.55
YLR297WQ05899 snR48snR48 113 nt-0.91□□□□□ -2.56
YLR297WQ05899 YNL266WYNL266W 420 nt-0.93□□□□□ -2.56
YLR297WQ05899 snR161snR161 161 nt-0.95□□□□□ -2.56
YLR297WQ05899 snR50snR50 90 nt-0.96□□□□□ -2.56
YLR297WQ05899 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1□□□□□ -2.57
YLR297WQ05899 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1□□□□□ -2.57
YLR297WQ05899 JLP2YMR132C 627 nt-1.01□□□□□ -2.57
YLR297WQ05899 YNL205CYNL205C 423 nt-1.01□□□□□ -2.57
YLR297WQ05899 snR52snR52 92 nt-1.01□□□□□ -2.57
YLR297WQ05899 snR80snR80 171 nt-1.02□□□□□ -2.57
YLR297WQ05899 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.07□□□□□ -2.58
YLR297WQ05899 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.08□□□□□ -2.58
YLR297WQ05899 YOR102WYOR102W 351 nt-1.11□□□□□ -2.59
YLR297WQ05899 snR67snR67 82 nt-1.12□□□□□ -2.59
YLR297WQ05899 YBR178WYBR178W 375 nt-1.13□□□□□ -2.59
YLR297WQ05899 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.13□□□□□ -2.59
YLR297WQ05899 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.15□□□□□ -2.59
YLR297WQ05899 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.17□□□□□ -2.6
YLR297WQ05899 YNR077CYNR077C 255 nt-1.17□□□□□ -2.6
YLR297WQ05899 SKI7YOR076C 2244 nt-1.25□□□□□ -2.61
YLR297WQ05899 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.26□□□□□ -2.61
YLR297WQ05899 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.33□□□□□ -2.62
YLR297WQ05899 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.33□□□□□ -2.62
YLR297WQ05899 Q0142Q0142 177 nt-1.34□□□□□ -2.62
YLR297WQ05899 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.34□□□□□ -2.62
YLR297WQ05899 YNL198CYNL198C 303 nt-1.35□□□□□ -2.63
YLR297WQ05899 YJL150WYJL150W 303 nt-1.42□□□□□ -2.64
YLR297WQ05899 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.46□□□□□ -2.64
YLR297WQ05899 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.46□□□□□ -2.64
YLR297WQ05899 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.53□□□□□ -2.65
YLR297WQ05899 YBL053WYBL053W 375 nt-1.53□□□□□ -2.65
YLR297WQ05899 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.57□□□□□ -2.66
YLR297WQ05899 SPG3YDR504C 384 nt-1.64□□□□□ -2.67
YLR297WQ05899 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.65□□□□□ -2.67
YLR297WQ05899 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.66□□□□□ -2.68
YLR297WQ05899 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.72□□□□□ -2.68
YLR297WQ05899 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.73□□□□□ -2.69
YLR297WQ05899 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.74□□□□□ -2.69
YLR297WQ05899 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.76□□□□□ -2.69
YLR297WQ05899 snR77snR77 88 nt-1.78□□□□□ -2.69
YLR297WQ05899 YGR151CYGR151C 336 nt-1.91□□□□□ -2.72
YLR297WQ05899 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.91□□□□□ -2.72
YLR297WQ05899 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.92□□□□□ -2.72
YLR297WQ05899 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.93□□□□□ -2.72
YLR297WQ05899 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.95□□□□□ -2.72
YLR297WQ05899 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.95□□□□□ -2.72
YLR297WQ05899 RPL41AYDL184C 78 nt-1.98□□□□□ -2.73
YLR297WQ05899 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2□□□□□ -2.73
YLR297WQ05899 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-2□□□□□ -2.73
YLR297WQ05899 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-2.01□□□□□ -2.73
YLR297WQ05899 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-2.02□□□□□ -2.73
YLR297WQ05899 snR81snR81 201 nt-2.04□□□□□ -2.74
YLR297WQ05899 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-2.08□□□□□ -2.74
YLR297WQ05899 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-2.09□□□□□ -2.74
YLR297WQ05899 YNL338WYNL338W 159 nt-2.1□□□□□ -2.75
YLR297WQ05899 snR38snR38 95 nt-2.1□□□□□ -2.75
YLR297WQ05899 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.11□□□□□ -2.75
YLR297WQ05899 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.24□□□□□ -2.77
YLR297WQ05899 snR47snR47 99 nt-2.24□□□□□ -2.77
YLR297WQ05899 YNL337WYNL337W 255 nt-2.29□□□□□ -2.78
YLR297WQ05899 Q0032Q0032 291 nt-2.34□□□□□ -2.78
YLR297WQ05899 YOR309CYOR309C 381 nt-2.43□□□□□ -2.8
YLR297WQ05899 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.47□□□□□ -2.8
YLR297WQ05899 YKL225WYKL225W 348 nt-2.52□□□□□ -2.81
YLR297WQ05899 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.56□□□□□ -2.82
YLR297WQ05899 YDR543CYDR543C 300 nt-2.57□□□□□ -2.82
YLR297WQ05899 snR6snR6 112 nt-2.59□□□□□ -2.82
YLR297WQ05899 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.63□□□□□ -2.83
YLR297WQ05899 snR61snR61 90 nt-2.67□□□□□ -2.84
YLR297WQ05899 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.69□□□□□ -2.84
YLR297WQ05899 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.72□□□□□ -2.84
YLR297WQ05899 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.73□□□□□ -2.85
YLR297WQ05899 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.74□□□□□ -2.85
YLR297WQ05899 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.77□□□□□ -2.85
YLR297WQ05899 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.78□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms