Protein–RNA interactions for Protein: Q03954

SPC19, DASH complex subunit SPC19, yeastyeast

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC19Q03954 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.49□□□□□ -2.49
SPC19Q03954 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.52□□□□□ -2.49
SPC19Q03954 snR46snR46 197 nt-0.52□□□□□ -2.49
SPC19Q03954 snR80snR80 171 nt-0.54□□□□□ -2.5
SPC19Q03954 Q0142Q0142 177 nt-0.54□□□□□ -2.5
SPC19Q03954 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.56□□□□□ -2.5
SPC19Q03954 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.57□□□□□ -2.5
SPC19Q03954 URB1YKL014C 5295 nt-0.58□□□□□ -2.5
SPC19Q03954 snR69snR69 101 nt-0.6□□□□□ -2.51
SPC19Q03954 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.6□□□□□ -2.51
SPC19Q03954 snR39BsnR39B 96 nt-0.61□□□□□ -2.51
SPC19Q03954 SEC10YLR166C 2616 nt-0.61□□□□□ -2.51
SPC19Q03954 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.62□□□□□ -2.51
SPC19Q03954 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.64□□□□□ -2.51
SPC19Q03954 snR48snR48 113 nt-0.64□□□□□ -2.51
SPC19Q03954 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.66□□□□□ -2.52
SPC19Q03954 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.66□□□□□ -2.52
SPC19Q03954 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.68□□□□□ -2.52
SPC19Q03954 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.68□□□□□ -2.52
SPC19Q03954 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.7□□□□□ -2.52
SPC19Q03954 snR52snR52 92 nt-0.7□□□□□ -2.52
SPC19Q03954 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.71□□□□□ -2.52
SPC19Q03954 RDS3YPR094W 324 nt-0.74□□□□□ -2.53
SPC19Q03954 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.76□□□□□ -2.53
SPC19Q03954 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.79□□□□□ -2.54
SPC19Q03954 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.82□□□□□ -2.54
SPC19Q03954 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.82□□□□□ -2.54
SPC19Q03954 YNL266WYNL266W 420 nt-0.84□□□□□ -2.54
SPC19Q03954 YNL205CYNL205C 423 nt-0.85□□□□□ -2.55
SPC19Q03954 snR50snR50 90 nt-0.85□□□□□ -2.55
SPC19Q03954 JLP2YMR132C 627 nt-0.87□□□□□ -2.55
SPC19Q03954 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.88□□□□□ -2.55
SPC19Q03954 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.91□□□□□ -2.56
SPC19Q03954 YOR102WYOR102W 351 nt-0.91□□□□□ -2.56
SPC19Q03954 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.92□□□□□ -2.56
SPC19Q03954 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.98□□□□□ -2.57
SPC19Q03954 snR33snR33 183 nt-0.99□□□□□ -2.57
SPC19Q03954 YBR178WYBR178W 375 nt-1□□□□□ -2.57
SPC19Q03954 YJL150WYJL150W 303 nt-1.03□□□□□ -2.57
SPC19Q03954 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
SPC19Q03954 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
SPC19Q03954 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
SPC19Q03954 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.05□□□□□ -2.58
SPC19Q03954 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.06□□□□□ -2.58
SPC19Q03954 snR67snR67 82 nt-1.07□□□□□ -2.58
SPC19Q03954 YNL198CYNL198C 303 nt-1.07□□□□□ -2.58
SPC19Q03954 SKI7YOR076C 2244 nt-1.15□□□□□ -2.59
SPC19Q03954 SPG3YDR504C 384 nt-1.19□□□□□ -2.6
SPC19Q03954 YBL053WYBL053W 375 nt-1.19□□□□□ -2.6
SPC19Q03954 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.2□□□□□ -2.6
SPC19Q03954 snR161snR161 161 nt-1.23□□□□□ -2.61
SPC19Q03954 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.24□□□□□ -2.61
SPC19Q03954 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.3□□□□□ -2.62
SPC19Q03954 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.33□□□□□ -2.62
SPC19Q03954 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.39□□□□□ -2.63
SPC19Q03954 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.4□□□□□ -2.63
SPC19Q03954 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.41□□□□□ -2.64
SPC19Q03954 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.47□□□□□ -2.64
SPC19Q03954 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.54□□□□□ -2.66
SPC19Q03954 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.59□□□□□ -2.66
SPC19Q03954 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.6□□□□□ -2.67
SPC19Q03954 YGR151CYGR151C 336 nt-1.61□□□□□ -2.67
SPC19Q03954 snR77snR77 88 nt-1.62□□□□□ -2.67
SPC19Q03954 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.64□□□□□ -2.67
SPC19Q03954 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.64□□□□□ -2.67
SPC19Q03954 YNL338WYNL338W 159 nt-1.74□□□□□ -2.69
SPC19Q03954 YNR077CYNR077C 255 nt-1.75□□□□□ -2.69
SPC19Q03954 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.75□□□□□ -2.69
SPC19Q03954 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.84□□□□□ -2.7
SPC19Q03954 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.85□□□□□ -2.71
SPC19Q03954 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.86□□□□□ -2.71
SPC19Q03954 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.86□□□□□ -2.71
SPC19Q03954 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.86□□□□□ -2.71
SPC19Q03954 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.87□□□□□ -2.71
SPC19Q03954 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.87□□□□□ -2.71
SPC19Q03954 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.89□□□□□ -2.71
SPC19Q03954 snR81snR81 201 nt-1.9□□□□□ -2.71
SPC19Q03954 YNL337WYNL337W 255 nt-1.91□□□□□ -2.72
SPC19Q03954 RPL41AYDL184C 78 nt-1.93□□□□□ -2.72
SPC19Q03954 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.96□□□□□ -2.72
SPC19Q03954 snR38snR38 95 nt-1.96□□□□□ -2.72
SPC19Q03954 Q0032Q0032 291 nt-1.97□□□□□ -2.72
SPC19Q03954 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.98□□□□□ -2.73
SPC19Q03954 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.06□□□□□ -2.74
SPC19Q03954 snR47snR47 99 nt-2.14□□□□□ -2.75
SPC19Q03954 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.19□□□□□ -2.76
SPC19Q03954 YOR309CYOR309C 381 nt-2.22□□□□□ -2.76
SPC19Q03954 snR6snR6 112 nt-2.39□□□□□ -2.79
SPC19Q03954 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.39□□□□□ -2.79
SPC19Q03954 YKL225WYKL225W 348 nt-2.42□□□□□ -2.8
SPC19Q03954 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.47□□□□□ -2.8
SPC19Q03954 snR61snR61 90 nt-2.49□□□□□ -2.81
SPC19Q03954 YOR225WYOR225W 330 nt-2.49□□□□□ -2.81
SPC19Q03954 YLR294CYLR294C 330 nt-2.5□□□□□ -2.81
SPC19Q03954 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.5□□□□□ -2.81
SPC19Q03954 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.53□□□□□ -2.81
SPC19Q03954 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.56□□□□□ -2.82
SPC19Q03954 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.56□□□□□ -2.82
SPC19Q03954 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.59□□□□□ -2.82
SPC19Q03954 snR73snR73 106 nt-2.62□□□□□ -2.83
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