Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 YGR164WYGR164W 336 nt-0.19□□□□□ -2.44
CIK1Q01649 YOR170WYOR170W 306 nt-0.19□□□□□ -2.44
CIK1Q01649 snR52snR52 92 nt-0.19□□□□□ -2.44
CIK1Q01649 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.2□□□□□ -2.44
CIK1Q01649 snR46snR46 197 nt-0.2□□□□□ -2.44
CIK1Q01649 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.24□□□□□ -2.45
CIK1Q01649 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.26□□□□□ -2.45
CIK1Q01649 snR69snR69 101 nt-0.29□□□□□ -2.46
CIK1Q01649 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.3□□□□□ -2.46
CIK1Q01649 SBH2YER019C-A 267 nt-0.34□□□□□ -2.46
CIK1Q01649 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.34□□□□□ -2.46
CIK1Q01649 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.34□□□□□ -2.46
CIK1Q01649 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.34□□□□□ -2.46
CIK1Q01649 snR48snR48 113 nt-0.35□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.36□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.37□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.37□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 YJL150WYJL150W 303 nt-0.38□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 YBL053WYBL053W 375 nt-0.39□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.39□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 snR50snR50 90 nt-0.39□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.4□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.4□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 JLP2YMR132C 627 nt-0.4□□□□□ -2.47
CIK1Q01649 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.42□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.42□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 YNL266WYNL266W 420 nt-0.43□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 RDS3YPR094W 324 nt-0.43□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 URB1YKL014C 5295 nt-0.43□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 SEC10YLR166C 2616 nt-0.43□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.45□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 YNL198CYNL198C 303 nt-0.45□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 YOR102WYOR102W 351 nt-0.45□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.47□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 YBR178WYBR178W 375 nt-0.47□□□□□ -2.48
CIK1Q01649 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.48□□□□□ -2.49
CIK1Q01649 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.5□□□□□ -2.49
CIK1Q01649 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.5□□□□□ -2.49
CIK1Q01649 SPG3YDR504C 384 nt-0.5□□□□□ -2.49
CIK1Q01649 YNL205CYNL205C 423 nt-0.51□□□□□ -2.49
CIK1Q01649 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.56□□□□□ -2.5
CIK1Q01649 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-0.59□□□□□ -2.5
CIK1Q01649 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.61□□□□□ -2.51
CIK1Q01649 snR67snR67 82 nt-0.66□□□□□ -2.52
CIK1Q01649 SKI7YOR076C 2244 nt-0.68□□□□□ -2.52
CIK1Q01649 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.69□□□□□ -2.52
CIK1Q01649 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.72□□□□□ -2.52
CIK1Q01649 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.73□□□□□ -2.53
CIK1Q01649 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-0.73□□□□□ -2.53
CIK1Q01649 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.74□□□□□ -2.53
CIK1Q01649 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
CIK1Q01649 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
CIK1Q01649 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
CIK1Q01649 snR33snR33 183 nt-0.75□□□□□ -2.53
CIK1Q01649 YGR151CYGR151C 336 nt-0.78□□□□□ -2.53
CIK1Q01649 YNL338WYNL338W 159 nt-0.8□□□□□ -2.54
CIK1Q01649 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.81□□□□□ -2.54
CIK1Q01649 snR161snR161 161 nt-0.86□□□□□ -2.55
CIK1Q01649 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.87□□□□□ -2.55
CIK1Q01649 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.91□□□□□ -2.56
CIK1Q01649 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.96□□□□□ -2.56
CIK1Q01649 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.02□□□□□ -2.57
CIK1Q01649 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
CIK1Q01649 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.05□□□□□ -2.58
CIK1Q01649 YNR077CYNR077C 255 nt-1.05□□□□□ -2.58
CIK1Q01649 YNL337WYNL337W 255 nt-1.06□□□□□ -2.58
CIK1Q01649 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.06□□□□□ -2.58
CIK1Q01649 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.09□□□□□ -2.58
CIK1Q01649 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.11□□□□□ -2.59
CIK1Q01649 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-1.14□□□□□ -2.59
CIK1Q01649 snR77snR77 88 nt-1.15□□□□□ -2.59
CIK1Q01649 snR38snR38 95 nt-1.17□□□□□ -2.6
CIK1Q01649 Q0032Q0032 291 nt-1.18□□□□□ -2.6
CIK1Q01649 snR81snR81 201 nt-1.18□□□□□ -2.6
CIK1Q01649 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.18□□□□□ -2.6
CIK1Q01649 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.19□□□□□ -2.6
CIK1Q01649 RPL41AYDL184C 78 nt-1.2□□□□□ -2.6
CIK1Q01649 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.21□□□□□ -2.6
CIK1Q01649 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.21□□□□□ -2.6
CIK1Q01649 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.23□□□□□ -2.61
CIK1Q01649 snR47snR47 99 nt-1.24□□□□□ -2.61
CIK1Q01649 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.27□□□□□ -2.61
CIK1Q01649 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.31□□□□□ -2.62
CIK1Q01649 YOR225WYOR225W 330 nt-1.32□□□□□ -2.62
CIK1Q01649 YLR294CYLR294C 330 nt-1.34□□□□□ -2.62
CIK1Q01649 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.37□□□□□ -2.63
CIK1Q01649 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.37□□□□□ -2.63
CIK1Q01649 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.38□□□□□ -2.63
CIK1Q01649 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.4□□□□□ -2.63
CIK1Q01649 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.41□□□□□ -2.64
CIK1Q01649 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.42□□□□□ -2.64
CIK1Q01649 YNL170WYNL170W 396 nt-1.48□□□□□ -2.65
CIK1Q01649 YKL225WYKL225W 348 nt-1.51□□□□□ -2.65
CIK1Q01649 snR61snR61 90 nt-1.52□□□□□ -2.65
CIK1Q01649 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.62□□□□□ -2.67
CIK1Q01649 YOR309CYOR309C 381 nt-1.66□□□□□ -2.68
CIK1Q01649 ATP8Q0080 147 nt-1.68□□□□□ -2.68
CIK1Q01649 snR62snR62 100 nt-1.69□□□□□ -2.68
CIK1Q01649 snR6snR6 112 nt-1.74□□□□□ -2.69
CIK1Q01649 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.76□□□□□ -2.69
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