Protein–RNA interactions for Protein: Q01448

HPC2, Histone promoter control protein 2, yeastyeast

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HPC2Q01448 CSE1YGL238W 2883 nt1.64□□□□□ -2.15
HPC2Q01448 snR50snR50 90 nt1.63□□□□□ -2.15
HPC2Q01448 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.62□□□□□ -2.15
HPC2Q01448 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.62□□□□□ -2.15
HPC2Q01448 PET127YOR017W 2403 nt1.61□□□□□ -2.15
HPC2Q01448 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.61□□□□□ -2.15
HPC2Q01448 YKL225WYKL225W 348 nt1.6□□□□□ -2.15
HPC2Q01448 RDS3YPR094W 324 nt1.6□□□□□ -2.15
HPC2Q01448 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.59□□□□□ -2.15
HPC2Q01448 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.54□□□□□ -2.16
HPC2Q01448 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.54□□□□□ -2.16
HPC2Q01448 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.54□□□□□ -2.16
HPC2Q01448 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.54□□□□□ -2.16
HPC2Q01448 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.54□□□□□ -2.16
HPC2Q01448 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.54□□□□□ -2.16
HPC2Q01448 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.54□□□□□ -2.16
HPC2Q01448 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.54□□□□□ -2.16
HPC2Q01448 HKR1YDR420W 5409 nt1.54□□□□□ -2.16
HPC2Q01448 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.53□□□□□ -2.16
HPC2Q01448 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.52□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 FYV8YGR196C 2454 nt1.52□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 NST1YNL091W 3723 nt1.51□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.51□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.51□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.51□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 SIP4YJL089W 2490 nt1.51□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 NIP1YMR309C 2439 nt1.5□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.5□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 RPL41AYDL184C 78 nt1.48□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 BUL2YML111W 2763 nt1.48□□□□□ -2.17
HPC2Q01448 RKR1YMR247C 4689 nt1.45□□□□□ -2.18
HPC2Q01448 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.44□□□□□ -2.18
HPC2Q01448 SCC2YDR180W 4482 nt1.42□□□□□ -2.18
HPC2Q01448 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.4□□□□□ -2.19
HPC2Q01448 snR38snR38 95 nt1.4□□□□□ -2.19
HPC2Q01448 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.34□□□□□ -2.19
HPC2Q01448 YPR117WYPR117W 7470 nt1.34□□□□□ -2.19
HPC2Q01448 YOL014WYOL014W 375 nt1.34□□□□□ -2.19
HPC2Q01448 AI1Q0050 2505 nt1.34□□□□□ -2.2
HPC2Q01448 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.32□□□□□ -2.2
HPC2Q01448 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.32□□□□□ -2.2
HPC2Q01448 SKI7YOR076C 2244 nt1.32□□□□□ -2.2
HPC2Q01448 DOP1YDR141C 5097 nt1.29□□□□□ -2.2
HPC2Q01448 BUD3YCL014W 4911 nt1.28□□□□□ -2.2
HPC2Q01448 LTE1YAL024C 4308 nt1.28□□□□□ -2.2
HPC2Q01448 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.27□□□□□ -2.21
HPC2Q01448 UTP20YBL004W 7482 nt1.27□□□□□ -2.21
HPC2Q01448 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.26□□□□□ -2.21
HPC2Q01448 PET111YMR257C 2403 nt1.26□□□□□ -2.21
HPC2Q01448 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.21□□□□□ -2.22
HPC2Q01448 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.18□□□□□ -2.22
HPC2Q01448 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.16□□□□□ -2.22
HPC2Q01448 VAM6YDL077C 3150 nt1.15□□□□□ -2.23
HPC2Q01448 YMR160WYMR160W 2451 nt1.12□□□□□ -2.23
HPC2Q01448 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.11□□□□□ -2.23
HPC2Q01448 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.11□□□□□ -2.23
HPC2Q01448 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
HPC2Q01448 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.11□□□□□ -2.23
HPC2Q01448 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
HPC2Q01448 snR67snR67 82 nt1.1□□□□□ -2.23
HPC2Q01448 snR75snR75 89 nt1.09□□□□□ -2.23
HPC2Q01448 MYO1YHR023W 5787 nt1.09□□□□□ -2.24
HPC2Q01448 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.08□□□□□ -2.24
HPC2Q01448 MLP1YKR095W 5628 nt1.07□□□□□ -2.24
HPC2Q01448 BEM2YER155C 6504 nt1.05□□□□□ -2.24
HPC2Q01448 YJR029WYJR029W 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
HPC2Q01448 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
HPC2Q01448 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.02□□□□□ -2.25
HPC2Q01448 MLP2YIL149C 5040 nt0.99□□□□□ -2.25
HPC2Q01448 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.91□□□□□ -2.26
HPC2Q01448 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.87□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.86□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 IQG1YPL242C 4488 nt0.84□□□□□ -2.27
HPC2Q01448 UTP10YJL109C 5310 nt0.8□□□□□ -2.28
HPC2Q01448 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.77□□□□□ -2.29
HPC2Q01448 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.73□□□□□ -2.29
HPC2Q01448 FMP27YLR454W 7887 nt0.7□□□□□ -2.3
HPC2Q01448 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.68□□□□□ -2.3
HPC2Q01448 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.67□□□□□ -2.3
HPC2Q01448 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.59□□□□□ -2.31
HPC2Q01448 SOV1YMR066W 2697 nt0.58□□□□□ -2.32
HPC2Q01448 THO2YNL139C 4794 nt0.56□□□□□ -2.32
HPC2Q01448 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.51□□□□□ -2.33
HPC2Q01448 ESP1YGR098C 4893 nt0.5□□□□□ -2.33
HPC2Q01448 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.46□□□□□ -2.34
HPC2Q01448 snR128snR128 126 nt0.46□□□□□ -2.34
HPC2Q01448 snR77snR77 88 nt0.45□□□□□ -2.34
HPC2Q01448 SBH2YER019C-A 267 nt0.43□□□□□ -2.34
HPC2Q01448 PAU9YBL108C-A 129 nt0.43□□□□□ -2.34
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