Protein–RNA interactions for Protein: P53976

YNL018C, Uncharacterized protein YNL018C, yeastyeast

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL018CP53976 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.92□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 ULP2YIL031W 3105 nt0.91□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.91□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 CSE1YGL238W 2883 nt0.9□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 YBR178WYBR178W 375 nt0.9□□□□□ -2.27
YNL018CP53976 RCO1YMR075W 2055 nt0.89□□□□□ -2.27
YNL018CP53976 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.89□□□□□ -2.27
YNL018CP53976 NNF2YGR089W 2811 nt0.89□□□□□ -2.27
YNL018CP53976 RPM2YML091C 3609 nt0.89□□□□□ -2.27
YNL018CP53976 MLP1YKR095W 5628 nt0.87□□□□□ -2.27
YNL018CP53976 YHR217CYHR217C 462 nt0.85□□□□□ -2.27
YNL018CP53976 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.83□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.83□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.82□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 SEC10YLR166C 2616 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 PET111YMR257C 2403 nt0.79□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 IQG1YPL242C 4488 nt0.79□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 NIP1YMR309C 2439 nt0.79□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 MYO1YHR023W 5787 nt0.79□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 SBH1YER087C-B 249 nt0.78□□□□□ -2.28
YNL018CP53976 snR69snR69 101 nt0.75□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 snR81snR81 201 nt0.75□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 FMP27YLR454W 7887 nt0.74□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.74□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 EST1YLR233C 2100 nt0.74□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 BUL2YML111W 2763 nt0.73□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 RPS26AYGL189C 360 nt0.73□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.73□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.72□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.72□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 AI1Q0050 2505 nt0.72□□□□□ -2.29
YNL018CP53976 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.69□□□□□ -2.3
YNL018CP53976 MLP2YIL149C 5040 nt0.68□□□□□ -2.3
YNL018CP53976 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.68□□□□□ -2.3
YNL018CP53976 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.68□□□□□ -2.3
YNL018CP53976 RDS3YPR094W 324 nt0.68□□□□□ -2.3
YNL018CP53976 ORC3YLL004W 1851 nt0.67□□□□□ -2.3
YNL018CP53976 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.65□□□□□ -2.31
YNL018CP53976 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.64□□□□□ -2.31
YNL018CP53976 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.63□□□□□ -2.31
YNL018CP53976 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.63□□□□□ -2.31
YNL018CP53976 THO2YNL139C 4794 nt0.62□□□□□ -2.31
YNL018CP53976 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.62□□□□□ -2.31
YNL018CP53976 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
YNL018CP53976 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.58□□□□□ -2.32
YNL018CP53976 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.58□□□□□ -2.32
YNL018CP53976 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.56□□□□□ -2.32
YNL018CP53976 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.55□□□□□ -2.32
YNL018CP53976 snR62snR62 100 nt0.52□□□□□ -2.33
YNL018CP53976 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.52□□□□□ -2.33
YNL018CP53976 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.51□□□□□ -2.33
YNL018CP53976 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.51□□□□□ -2.33
YNL018CP53976 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.5□□□□□ -2.33
YNL018CP53976 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.49□□□□□ -2.33
YNL018CP53976 snR47snR47 99 nt0.48□□□□□ -2.33
YNL018CP53976 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.47□□□□□ -2.33
YNL018CP53976 snR50snR50 90 nt0.47□□□□□ -2.33
YNL018CP53976 snR45snR45 172 nt0.46□□□□□ -2.34
YNL018CP53976 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.45□□□□□ -2.34
YNL018CP53976 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.44□□□□□ -2.34
YNL018CP53976 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.44□□□□□ -2.34
YNL018CP53976 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.41□□□□□ -2.34
YNL018CP53976 ESP1YGR098C 4893 nt0.36□□□□□ -2.35
YNL018CP53976 snR67snR67 82 nt0.33□□□□□ -2.36
YNL018CP53976 RPL41AYDL184C 78 nt0.32□□□□□ -2.36
YNL018CP53976 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.32□□□□□ -2.36
YNL018CP53976 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.3□□□□□ -2.36
YNL018CP53976 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.28□□□□□ -2.36
YNL018CP53976 SOV1YMR066W 2697 nt0.25□□□□□ -2.37
YNL018CP53976 snR128snR128 126 nt0.23□□□□□ -2.37
YNL018CP53976 YKL225WYKL225W 348 nt0.21□□□□□ -2.38
YNL018CP53976 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.21□□□□□ -2.38
YNL018CP53976 YJL113WYJL113W 4647 nt0.19□□□□□ -2.38
YNL018CP53976 snR38snR38 95 nt0.19□□□□□ -2.38
YNL018CP53976 snR64snR64 101 nt0.13□□□□□ -2.39
YNL018CP53976 SKI7YOR076C 2244 nt0.09□□□□□ -2.4
YNL018CP53976 PAU9YBL108C-A 129 nt0.08□□□□□ -2.4
YNL018CP53976 snR53snR53 91 nt0□□□□□ -2.41
YNL018CP53976 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.03□□□□□ -2.41
YNL018CP53976 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.07□□□□□ -2.42
YNL018CP53976 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.1□□□□□ -2.43
YNL018CP53976 SBH2YER019C-A 267 nt-0.11□□□□□ -2.43
YNL018CP53976 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.11□□□□□ -2.43
YNL018CP53976 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.16□□□□□ -2.44
YNL018CP53976 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.26□□□□□ -2.45
YNL018CP53976 snR161snR161 161 nt-0.28□□□□□ -2.45
YNL018CP53976 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.3□□□□□ -2.46
YNL018CP53976 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.34□□□□□ -2.46
YNL018CP53976 snR77snR77 88 nt-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms