Protein–RNA interactions for Protein: P53906

YNL146W, Uncharacterized protein YNL146W, yeast

Predictions only

Length 100 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL146W	P53906	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
YNL146W	P53906	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
YNL146W	P53906	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
YNL146W	P53906	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
YNL146W	P53906	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
YNL146W	P53906	snR46	snR46	197 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
YNL146W	P53906	snR69	snR69	101 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
YNL146W	P53906	snR39B	snR39B	96 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
YNL146W	P53906	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
YNL146W	P53906	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
YNL146W	P53906	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
YNL146W	P53906	snR80	snR80	171 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
YNL146W	P53906	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
YNL146W	P53906	snR48	snR48	113 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
YNL146W	P53906	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
YNL146W	P53906	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
YNL146W	P53906	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
YNL146W	P53906	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
YNL146W	P53906	RDS3	YPR094W	324 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
YNL146W	P53906	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
YNL146W	P53906	Q0142	Q0142	177 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
YNL146W	P53906	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
YNL146W	P53906	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
YNL146W	P53906	snR52	snR52	92 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
YNL146W	P53906	SEC10	YLR166C	2616 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
YNL146W	P53906	YNL266W	YNL266W	420 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YNL146W	P53906	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YNL146W	P53906	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YNL146W	P53906	YNL205C	YNL205C	423 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
YNL146W	P53906	snR50	snR50	90 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
YNL146W	P53906	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
YNL146W	P53906	JLP2	YMR132C	627 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
YNL146W	P53906	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
YNL146W	P53906	YOR102W	YOR102W	351 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
YNL146W	P53906	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
YNL146W	P53906	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YNL146W	P53906	YBR178W	YBR178W	375 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YNL146W	P53906	snR67	snR67	82 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
YNL146W	P53906	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
YNL146W	P53906	YJL150W	YJL150W	303 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
YNL146W	P53906	snR33	snR33	183 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
YNL146W	P53906	YNL198C	YNL198C	303 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YNL146W	P53906	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
YNL146W	P53906	SKI7	YOR076C	2244 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
YNL146W	P53906	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YNL146W	P53906	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
YNL146W	P53906	YBL053W	YBL053W	375 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
YNL146W	P53906	SPG3	YDR504C	384 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
YNL146W	P53906	snR161	snR161	161 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
YNL146W	P53906	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
YNL146W	P53906	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
YNL146W	P53906	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
YNL146W	P53906	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
YNL146W	P53906	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
YNL146W	P53906	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
YNL146W	P53906	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
YNL146W	P53906	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.4	□□□□□ -2.63
YNL146W	P53906	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
YNL146W	P53906	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
YNL146W	P53906	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
YNL146W	P53906	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
YNL146W	P53906	YGR151C	YGR151C	336 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
YNL146W	P53906	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
YNL146W	P53906	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
YNL146W	P53906	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
YNL146W	P53906	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-1.61	□□□□□ -2.67
YNL146W	P53906	snR77	snR77	88 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
YNL146W	P53906	YNL338W	YNL338W	159 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
YNL146W	P53906	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
YNL146W	P53906	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
YNL146W	P53906	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-1.68	□□□□□ -2.68
YNL146W	P53906	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-1.68	□□□□□ -2.68
YNL146W	P53906	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
YNL146W	P53906	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
YNL146W	P53906	RPL41A	YDL184C	78 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
YNL146W	P53906	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
YNL146W	P53906	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
YNL146W	P53906	YNL337W	YNL337W	255 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
YNL146W	P53906	snR38	snR38	95 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
YNL146W	P53906	Q0032	Q0032	291 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
YNL146W	P53906	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
YNL146W	P53906	snR81	snR81	201 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
YNL146W	P53906	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
YNL146W	P53906	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
YNL146W	P53906	snR47	snR47	99 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
YNL146W	P53906	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
YNL146W	P53906	YKL225W	YKL225W	348 nt		-2.18	□□□□□ -2.76
YNL146W	P53906	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-2.19	□□□□□ -2.76
YNL146W	P53906	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-2.22	□□□□□ -2.76
YNL146W	P53906	snR61	snR61	90 nt		-2.23	□□□□□ -2.77
YNL146W	P53906	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-2.25	□□□□□ -2.77
YNL146W	P53906	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2.26	□□□□□ -2.77
YNL146W	P53906	YLR294C	YLR294C	330 nt		-2.3	□□□□□ -2.78
YNL146W	P53906	YOR225W	YOR225W	330 nt		-2.3	□□□□□ -2.78
YNL146W	P53906	snR6	snR6	112 nt		-2.34	□□□□□ -2.78
YNL146W	P53906	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-2.39	□□□□□ -2.79
YNL146W	P53906	snR62	snR62	100 nt		-2.41	□□□□□ -2.8
YNL146W	P53906	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-2.41	□□□□□ -2.8
YNL146W	P53906	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-2.43	□□□□□ -2.8
YNL146W	P53906	YNL170W	YNL170W	396 nt		-2.43	□□□□□ -2.8

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.7 ms