Protein–RNA interactions for Protein: P53292

MRPS35, 37S ribosomal protein S35, mitochondrial, yeastyeast

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPS35P53292 SPT7YBR081C 3999 nt1.18□□□□□ -2.22
MRPS35P53292 YJR029WYJR029W 5268 nt1.18□□□□□ -2.22
MRPS35P53292 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.18□□□□□ -2.22
MRPS35P53292 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.17□□□□□ -2.22
MRPS35P53292 SEC10YLR166C 2616 nt1.16□□□□□ -2.22
MRPS35P53292 snR53snR53 91 nt1.14□□□□□ -2.23
MRPS35P53292 snR64snR64 101 nt1.12□□□□□ -2.23
MRPS35P53292 CSE1YGL238W 2883 nt1.11□□□□□ -2.23
MRPS35P53292 SCC2YDR180W 4482 nt1.11□□□□□ -2.23
MRPS35P53292 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.1□□□□□ -2.23
MRPS35P53292 EST1YLR233C 2100 nt1.1□□□□□ -2.23
MRPS35P53292 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.09□□□□□ -2.23
MRPS35P53292 PAU24YBR301W 363 nt1.08□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 DOP1YDR141C 5097 nt1.07□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 VAM6YDL077C 3150 nt1.06□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.06□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.05□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 RKR1YMR247C 4689 nt1.05□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 NST1YNL091W 3723 nt1.04□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 YKL225WYKL225W 348 nt1.04□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 snR38snR38 95 nt1.04□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.03□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 snR69snR69 101 nt1.03□□□□□ -2.24
MRPS35P53292 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.02□□□□□ -2.25
MRPS35P53292 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.02□□□□□ -2.25
MRPS35P53292 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.02□□□□□ -2.25
MRPS35P53292 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.01□□□□□ -2.25
MRPS35P53292 snR50snR50 90 nt1□□□□□ -2.25
MRPS35P53292 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.99□□□□□ -2.25
MRPS35P53292 PAU12YGR294W 363 nt0.99□□□□□ -2.25
MRPS35P53292 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPS35P53292 AI1Q0050 2505 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPS35P53292 NIP1YMR309C 2439 nt0.97□□□□□ -2.25
MRPS35P53292 RDS3YPR094W 324 nt0.96□□□□□ -2.26
MRPS35P53292 LTE1YAL024C 4308 nt0.95□□□□□ -2.26
MRPS35P53292 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.94□□□□□ -2.26
MRPS35P53292 BUL2YML111W 2763 nt0.94□□□□□ -2.26
MRPS35P53292 MLP2YIL149C 5040 nt0.93□□□□□ -2.26
MRPS35P53292 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.9□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 RPL41AYDL184C 78 nt0.89□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 PET111YMR257C 2403 nt0.89□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 THO2YNL139C 4794 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.85□□□□□ -2.27
MRPS35P53292 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.83□□□□□ -2.28
MRPS35P53292 UTP20YBL004W 7482 nt0.83□□□□□ -2.28
MRPS35P53292 SKI7YOR076C 2244 nt0.82□□□□□ -2.28
MRPS35P53292 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.81□□□□□ -2.28
MRPS35P53292 MLP1YKR095W 5628 nt0.81□□□□□ -2.28
MRPS35P53292 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.78□□□□□ -2.28
MRPS35P53292 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P53292 YMR160WYMR160W 2451 nt0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P53292 YOL014WYOL014W 375 nt0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P53292 snR75snR75 89 nt0.73□□□□□ -2.29
MRPS35P53292 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.68□□□□□ -2.3
MRPS35P53292 IQG1YPL242C 4488 nt0.68□□□□□ -2.3
MRPS35P53292 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.67□□□□□ -2.3
MRPS35P53292 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.64□□□□□ -2.31
MRPS35P53292 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.64□□□□□ -2.31
MRPS35P53292 FMP27YLR454W 7887 nt0.63□□□□□ -2.31
MRPS35P53292 snR67snR67 82 nt0.62□□□□□ -2.31
MRPS35P53292 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
MRPS35P53292 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
MRPS35P53292 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.52□□□□□ -2.33
MRPS35P53292 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.52□□□□□ -2.33
MRPS35P53292 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.52□□□□□ -2.33
MRPS35P53292 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.48□□□□□ -2.33
MRPS35P53292 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.46□□□□□ -2.34
MRPS35P53292 SOV1YMR066W 2697 nt0.45□□□□□ -2.34
MRPS35P53292 ESP1YGR098C 4893 nt0.37□□□□□ -2.35
MRPS35P53292 snR77snR77 88 nt0.34□□□□□ -2.36
MRPS35P53292 snR128snR128 126 nt0.33□□□□□ -2.36
MRPS35P53292 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.31□□□□□ -2.36
MRPS35P53292 snR40snR40 97 nt0.31□□□□□ -2.36
MRPS35P53292 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.3□□□□□ -2.36
MRPS35P53292 PAU9YBL108C-A 129 nt0.28□□□□□ -2.36
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