Protein–RNA interactions for Protein: P53095

DSD1, D-serine dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSD1P53095 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.51□□□□□ -2.33
DSD1P53095 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.51□□□□□ -2.33
DSD1P53095 YNL338WYNL338W 159 nt0.5□□□□□ -2.33
DSD1P53095 YOR225WYOR225W 330 nt0.48□□□□□ -2.33
DSD1P53095 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.47□□□□□ -2.33
DSD1P53095 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.47□□□□□ -2.33
DSD1P53095 ORC3YLL004W 1851 nt0.47□□□□□ -2.33
DSD1P53095 CSE1YGL238W 2883 nt0.47□□□□□ -2.33
DSD1P53095 YDR210WYDR210W 228 nt0.46□□□□□ -2.34
DSD1P53095 snR39BsnR39B 96 nt0.44□□□□□ -2.34
DSD1P53095 YBL053WYBL053W 375 nt0.43□□□□□ -2.34
DSD1P53095 RCO1YMR075W 2055 nt0.42□□□□□ -2.34
DSD1P53095 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.4□□□□□ -2.35
DSD1P53095 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.39□□□□□ -2.35
DSD1P53095 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.38□□□□□ -2.35
DSD1P53095 YLR294CYLR294C 330 nt0.37□□□□□ -2.35
DSD1P53095 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.37□□□□□ -2.35
DSD1P53095 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.37□□□□□ -2.35
DSD1P53095 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.35□□□□□ -2.35
DSD1P53095 YBR099CYBR099C 384 nt0.35□□□□□ -2.35
DSD1P53095 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.3□□□□□ -2.36
DSD1P53095 THO2YNL139C 4794 nt0.29□□□□□ -2.36
DSD1P53095 YNL205CYNL205C 423 nt0.28□□□□□ -2.36
DSD1P53095 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.28□□□□□ -2.36
DSD1P53095 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.26□□□□□ -2.37
DSD1P53095 ESP1YGR098C 4893 nt0.26□□□□□ -2.37
DSD1P53095 EST1YLR233C 2100 nt0.24□□□□□ -2.37
DSD1P53095 PMP2YEL017C-A 132 nt0.23□□□□□ -2.37
DSD1P53095 snR69snR69 101 nt0.22□□□□□ -2.37
DSD1P53095 SOM1YEL059C-A 225 nt0.22□□□□□ -2.37
DSD1P53095 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.21□□□□□ -2.38
DSD1P53095 YGR164WYGR164W 336 nt0.21□□□□□ -2.38
DSD1P53095 SOV1YMR066W 2697 nt0.17□□□□□ -2.38
DSD1P53095 SEC10YLR166C 2616 nt0.16□□□□□ -2.38
DSD1P53095 RDS3YPR094W 324 nt0.14□□□□□ -2.39
DSD1P53095 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.13□□□□□ -2.39
DSD1P53095 YNL266WYNL266W 420 nt0.13□□□□□ -2.39
DSD1P53095 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.13□□□□□ -2.39
DSD1P53095 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.11□□□□□ -2.39
DSD1P53095 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.11□□□□□ -2.39
DSD1P53095 YBR178WYBR178W 375 nt0.07□□□□□ -2.4
DSD1P53095 snR45snR45 172 nt0.07□□□□□ -2.4
DSD1P53095 snR128snR128 126 nt0.06□□□□□ -2.4
DSD1P53095 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.06□□□□□ -2.4
DSD1P53095 YNL170WYNL170W 396 nt0.04□□□□□ -2.4
DSD1P53095 YJL113WYJL113W 4647 nt0.04□□□□□ -2.4
DSD1P53095 ATP8Q0080 147 nt0.01□□□□□ -2.41
DSD1P53095 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.01□□□□□ -2.41
DSD1P53095 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.01□□□□□ -2.41
DSD1P53095 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0□□□□□ -2.41
DSD1P53095 snR50snR50 90 nt-0.05□□□□□ -2.42
DSD1P53095 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSD1P53095 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSD1P53095 Q0092Q0092 141 nt-0.09□□□□□ -2.42
DSD1P53095 snR67snR67 82 nt-0.18□□□□□ -2.44
DSD1P53095 SBH2YER019C-A 267 nt-0.22□□□□□ -2.44
DSD1P53095 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.25□□□□□ -2.45
DSD1P53095 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.25□□□□□ -2.45
DSD1P53095 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.27□□□□□ -2.45
DSD1P53095 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.27□□□□□ -2.45
DSD1P53095 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.27□□□□□ -2.45
DSD1P53095 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.3□□□□□ -2.46
DSD1P53095 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.3□□□□□ -2.46
DSD1P53095 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.3□□□□□ -2.46
DSD1P53095 snR61snR61 90 nt-0.31□□□□□ -2.46
DSD1P53095 snR81snR81 201 nt-0.31□□□□□ -2.46
DSD1P53095 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.32□□□□□ -2.46
DSD1P53095 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.36□□□□□ -2.47
DSD1P53095 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.38□□□□□ -2.47
DSD1P53095 SKI7YOR076C 2244 nt-0.38□□□□□ -2.47
DSD1P53095 Q0143Q0143 153 nt-0.4□□□□□ -2.47
DSD1P53095 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.41□□□□□ -2.48
DSD1P53095 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.48□□□□□ -2.49
DSD1P53095 RPL41AYDL184C 78 nt-0.49□□□□□ -2.49
DSD1P53095 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.49□□□□□ -2.49
DSD1P53095 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.5□□□□□ -2.49
DSD1P53095 snR47snR47 99 nt-0.5□□□□□ -2.49
DSD1P53095 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.55□□□□□ -2.5
DSD1P53095 URB1YKL014C 5295 nt-0.55□□□□□ -2.5
DSD1P53095 snR85snR85 171 nt-0.58□□□□□ -2.5
DSD1P53095 YMR326CYMR326C 309 nt-0.63□□□□□ -2.51
DSD1P53095 snR38snR38 95 nt-0.63□□□□□ -2.51
DSD1P53095 snR161snR161 161 nt-0.64□□□□□ -2.51
DSD1P53095 snR33snR33 183 nt-0.64□□□□□ -2.51
DSD1P53095 snR62snR62 100 nt-0.65□□□□□ -2.51
DSD1P53095 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.66□□□□□ -2.52
DSD1P53095 YHR217CYHR217C 462 nt-0.69□□□□□ -2.52
DSD1P53095 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.69□□□□□ -2.52
DSD1P53095 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.7□□□□□ -2.52
DSD1P53095 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.72□□□□□ -2.52
DSD1P53095 YKL225WYKL225W 348 nt-0.75□□□□□ -2.53
DSD1P53095 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
DSD1P53095 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
DSD1P53095 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
DSD1P53095 YBL109WYBL109W 336 nt-0.8□□□□□ -2.54
DSD1P53095 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
DSD1P53095 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.83□□□□□ -2.54
DSD1P53095 snR77snR77 88 nt-0.87□□□□□ -2.55
DSD1P53095 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.92□□□□□ -2.56
DSD1P53095 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.93□□□□□ -2.56
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