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Protein–RNA interactions for Protein: P40462
TMA108, Protein TMA108, yeast
Predictions only
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946 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
TMA108
P40462
FMP27
YLR454W
7887 nt
0.58
□□□□□ -2.32
TMA108
P40462
Q0092
Q0092
141 nt
0.57
□□□□□ -2.32
TMA108
P40462
YNL170W
YNL170W
396 nt
0.57
□□□□□ -2.32
TMA108
P40462
YDR371C-A
YDR371C-A
105 nt
0.54
□□□□□ -2.32
TMA108
P40462
BUL2
YML111W
2763 nt
0.53
□□□□□ -2.32
TMA108
P40462
SBH1
YER087C-B
249 nt
0.53
□□□□□ -2.32
TMA108
P40462
RPS26A
YGL189C
360 nt
0.53
□□□□□ -2.32
TMA108
P40462
YCL001W-B
YCL001W-B
255 nt
0.53
□□□□□ -2.32
TMA108
P40462
GLG1
YKR058W
1851 nt
0.52
□□□□□ -2.33
TMA108
P40462
ORC3
YLL004W
1851 nt
0.52
□□□□□ -2.33
TMA108
P40462
NIP1
YMR309C
2439 nt
0.52
□□□□□ -2.33
TMA108
P40462
YIL071W-A
YIL071W-A
477 nt
0.52
□□□□□ -2.33
TMA108
P40462
MLP2
YIL149C
5040 nt
0.51
□□□□□ -2.33
TMA108
P40462
CSE1
YGL238W
2883 nt
0.5
□□□□□ -2.33
TMA108
P40462
YGR146C-A
YGR146C-A
162 nt
0.48
□□□□□ -2.33
TMA108
P40462
YKL145W-A
YKL145W-A
93 nt
0.48
□□□□□ -2.33
TMA108
P40462
SOM1
YEL059C-A
225 nt
0.46
□□□□□ -2.34
TMA108
P40462
YOL014W
YOL014W
375 nt
0.44
□□□□□ -2.34
TMA108
P40462
YNL054W-B
YNL054W-B
5250 nt
0.42
□□□□□ -2.34
TMA108
P40462
YCR095W-A
YCR095W-A
159 nt
0.42
□□□□□ -2.34
TMA108
P40462
RPM2
YML091C
3609 nt
0.42
□□□□□ -2.34
TMA108
P40462
YNL205C
YNL205C
423 nt
0.4
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
BIR1
YJR089W
2865 nt
0.4
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
RCO1
YMR075W
2055 nt
0.39
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
AI1
Q0050
2505 nt
0.38
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
YBR099C
YBR099C
384 nt
0.38
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
EST1
YLR233C
2100 nt
0.38
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
YBL100W-B
YBL100W-B
5313 nt
0.37
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
PMP2
YEL017C-A
132 nt
0.36
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
ESP1
YGR098C
4893 nt
0.36
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
YNL266W
YNL266W
420 nt
0.35
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
YPL060C-A
YPL060C-A
3315 nt
0.35
□□□□□ -2.35
TMA108
P40462
snR69
snR69
101 nt
0.34
□□□□□ -2.36
TMA108
P40462
SEC10
YLR166C
2616 nt
0.33
□□□□□ -2.36
TMA108
P40462
YBR178W
YBR178W
375 nt
0.32
□□□□□ -2.36
TMA108
P40462
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.3
□□□□□ -2.36
TMA108
P40462
tD(GUC)Q
tD(GUC)Q
75 nt
0.28
□□□□□ -2.36
TMA108
P40462
YOR186C-A
YOR186C-A
210 nt
0.28
□□□□□ -2.36
TMA108
P40462
YNL103W-A
YNL103W-A
90 nt
0.27
□□□□□ -2.37
TMA108
P40462
tQ(UUG)Q
tQ(UUG)Q
76 nt
0.26
□□□□□ -2.37
TMA108
P40462
RDS3
YPR094W
324 nt
0.25
□□□□□ -2.37
TMA108
P40462
Q0143
Q0143
153 nt
0.24
□□□□□ -2.37
TMA108
P40462
YJL077W-A
YJL077W-A
87 nt
0.24
□□□□□ -2.37
TMA108
P40462
YBR196C-A
YBR196C-A
150 nt
0.24
□□□□□ -2.37
TMA108
P40462
YLR286W-A
YLR286W-A
135 nt
0.21
□□□□□ -2.38
TMA108
P40462
SOV1
YMR066W
2697 nt
0.2
□□□□□ -2.38
TMA108
P40462
THO2
YNL139C
4794 nt
0.2
□□□□□ -2.38
TMA108
P40462
YDL159C-B
YDL159C-B
177 nt
0.19
□□□□□ -2.38
TMA108
P40462
snR50
snR50
90 nt
0.18
□□□□□ -2.38
TMA108
P40462
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YER078W-A
165 nt
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□□□□□ -2.38
TMA108
P40462
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YER090C-A
90 nt
0.15
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TMA108
P40462
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YLR299C-A
93 nt
0.14
□□□□□ -2.39
TMA108
P40462
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YOL083C-A
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TMA108
P40462
snR61
snR61
90 nt
0.13
□□□□□ -2.39
TMA108
P40462
snR81
snR81
201 nt
0.13
□□□□□ -2.39
TMA108
P40462
snR85
snR85
171 nt
0.13
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TMA108
P40462
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YGL041C-B
183 nt
0.12
□□□□□ -2.39
TMA108
P40462
YBL071C-B
YBL071C-B
99 nt
0.11
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TMA108
P40462
TFB5
YDR079C-A
219 nt
0.1
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TMA108
P40462
snR128
snR128
126 nt
0.09
□□□□□ -2.4
TMA108
P40462
YAL037C-A
YAL037C-A
93 nt
0.08
□□□□□ -2.4
TMA108
P40462
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YML054C-A
159 nt
0.04
□□□□□ -2.4
TMA108
P40462
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YML100W-A
174 nt
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□□□□□ -2.4
TMA108
P40462
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YOL164W-A
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0.02
□□□□□ -2.41
TMA108
P40462
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YBL109W
336 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
TMA108
P40462
snR45
snR45
172 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
TMA108
P40462
snR67
snR67
82 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
TMA108
P40462
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YHR180C-B
105 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
TMA108
P40462
YMR326C
YMR326C
309 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
TMA108
P40462
snR47
snR47
99 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
TMA108
P40462
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YGR240C-A
201 nt
-0.09
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TMA108
P40462
tS(GCU)Q1
tS(GCU)Q1
86 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
TMA108
P40462
SKI7
YOR076C
2244 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
TMA108
P40462
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YHR217C
462 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
TMA108
P40462
YBR109W-A
YBR109W-A
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-0.1
□□□□□ -2.43
TMA108
P40462
PAU9
YBL108C-A
129 nt
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TMA108
P40462
YBL100W-C
YBL100W-C
120 nt
-0.12
□□□□□ -2.43
TMA108
P40462
YJL113W
YJL113W
4647 nt
-0.14
□□□□□ -2.43
TMA108
P40462
YDR524C-A
YDR524C-A
120 nt
-0.15
□□□□□ -2.43
TMA108
P40462
RPL41A
YDL184C
78 nt
-0.16
□□□□□ -2.44
TMA108
P40462
snR38
snR38
95 nt
-0.16
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TMA108
P40462
snR62
snR62
100 nt
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TMA108
P40462
SBH2
YER019C-A
267 nt
-0.18
□□□□□ -2.44
TMA108
P40462
YDR034C-A
YDR034C-A
177 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
TMA108
P40462
tA(UGC)Q
tA(UGC)Q
76 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
TMA108
P40462
YBR296C-A
YBR296C-A
120 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
TMA108
P40462
YKL225W
YKL225W
348 nt
-0.28
□□□□□ -2.45
TMA108
P40462
YLL066W-B
YLL066W-B
171 nt
-0.29
□□□□□ -2.46
TMA108
P40462
YOR376W-A
YOR376W-A
156 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
TMA108
P40462
YKL106C-A
YKL106C-A
120 nt
-0.37
□□□□□ -2.47
TMA108
P40462
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YDL247W-A
75 nt
-0.39
□□□□□ -2.47
TMA108
P40462
snR161
snR161
161 nt
-0.41
□□□□□ -2.48
TMA108
P40462
snR64
snR64
101 nt
-0.44
□□□□□ -2.48
TMA108
P40462
YDL159W-A
YDL159W-A
132 nt
-0.47
□□□□□ -2.48
TMA108
P40462
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
TMA108
P40462
YOR316C-A
YOR316C-A
210 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
TMA108
P40462
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YGR122C-A
129 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
TMA108
P40462
snR33
snR33
183 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
TMA108
P40462
snR77
snR77
88 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
TMA108
P40462
snR53
snR53
91 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
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