Protein–RNA interactions for Protein: P38840

ARO9, Aromatic amino acid aminotransferase 2, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 513 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARO9	P38840	Q0143	Q0143	153 nt		0.58	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	SBH1	YER087C-B	249 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)B	tT(AGU)B	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)C	tT(AGU)C	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)D	tT(AGU)D	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)H	tT(AGU)H	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)I1	tT(AGU)I1	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)I2	tT(AGU)I2	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)J	tT(AGU)J	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)N1	tT(AGU)N1	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)N2	tT(AGU)N2	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)O1	tT(AGU)O1	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tT(AGU)O2	tT(AGU)O2	73 nt		0.57	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	ORC3	YLL004W	1851 nt		0.56	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		0.56	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	SEC10	YLR166C	2616 nt		0.55	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	IQG1	YPL242C	4488 nt		0.55	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tF(GAA)B	tF(GAA)B	73 nt		0.54	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tF(GAA)F	tF(GAA)F	73 nt		0.54	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tF(GAA)G	tF(GAA)G	73 nt		0.54	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tF(GAA)H1	tF(GAA)H1	73 nt		0.54	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tF(GAA)H2	tF(GAA)H2	73 nt		0.54	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tF(GAA)M	tF(GAA)M	73 nt		0.54	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tF(GAA)P1	tF(GAA)P1	73 nt		0.54	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	tF(GAA)P2	tF(GAA)P2	73 nt		0.54	□□□□□ -2.32
ARO9	P38840	snR69	snR69	101 nt		0.52	□□□□□ -2.33
ARO9	P38840	YBR178W	YBR178W	375 nt		0.52	□□□□□ -2.33
ARO9	P38840	EST1	YLR233C	2100 nt		0.52	□□□□□ -2.33
ARO9	P38840	snR85	snR85	171 nt		0.51	□□□□□ -2.33
ARO9	P38840	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		0.5	□□□□□ -2.33
ARO9	P38840	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		0.49	□□□□□ -2.33
ARO9	P38840	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		0.49	□□□□□ -2.33
ARO9	P38840	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		0.48	□□□□□ -2.33
ARO9	P38840	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		0.47	□□□□□ -2.33
ARO9	P38840	RDS3	YPR094W	324 nt		0.47	□□□□□ -2.33
ARO9	P38840	MLP2	YIL149C	5040 nt		0.46	□□□□□ -2.34
ARO9	P38840	snR61	snR61	90 nt		0.44	□□□□□ -2.34
ARO9	P38840	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		0.44	□□□□□ -2.34
ARO9	P38840	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		0.44	□□□□□ -2.34
ARO9	P38840	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		0.43	□□□□□ -2.34
ARO9	P38840	YOL014W	YOL014W	375 nt		0.39	□□□□□ -2.35
ARO9	P38840	FMP27	YLR454W	7887 nt		0.38	□□□□□ -2.35
ARO9	P38840	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		0.37	□□□□□ -2.35
ARO9	P38840	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		0.37	□□□□□ -2.35
ARO9	P38840	TFB5	YDR079C-A	219 nt		0.35	□□□□□ -2.35
ARO9	P38840	AI1	Q0050	2505 nt		0.35	□□□□□ -2.35
ARO9	P38840	YNL054W-B	YNL054W-B	5250 nt		0.34	□□□□□ -2.36
ARO9	P38840	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		0.33	□□□□□ -2.36
ARO9	P38840	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		0.33	□□□□□ -2.36
ARO9	P38840	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		0.32	□□□□□ -2.36
ARO9	P38840	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		0.29	□□□□□ -2.36
ARO9	P38840	YMR326C	YMR326C	309 nt		0.29	□□□□□ -2.36
ARO9	P38840	YOL013W-A	YOL013W-A	192 nt		0.28	□□□□□ -2.36
ARO9	P38840	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		0.28	□□□□□ -2.36
ARO9	P38840	snR81	snR81	201 nt		0.27	□□□□□ -2.37
ARO9	P38840	ESP1	YGR098C	4893 nt		0.25	□□□□□ -2.37
ARO9	P38840	snR50	snR50	90 nt		0.22	□□□□□ -2.37
ARO9	P38840	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		0.21	□□□□□ -2.38
ARO9	P38840	SOV1	YMR066W	2697 nt		0.2	□□□□□ -2.38
ARO9	P38840	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		0.19	□□□□□ -2.38
ARO9	P38840	snR128	snR128	126 nt		0.18	□□□□□ -2.38
ARO9	P38840	YHR217C	YHR217C	462 nt		0.17	□□□□□ -2.38
ARO9	P38840	THO2	YNL139C	4794 nt		0.16	□□□□□ -2.38
ARO9	P38840	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		0.15	□□□□□ -2.39
ARO9	P38840	YER078W-A	YER078W-A	165 nt		0.15	□□□□□ -2.39
ARO9	P38840	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		0.15	□□□□□ -2.39
ARO9	P38840	YBL109W	YBL109W	336 nt		0.14	□□□□□ -2.39
ARO9	P38840	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		0.13	□□□□□ -2.39
ARO9	P38840	snR67	snR67	82 nt		0.12	□□□□□ -2.39
ARO9	P38840	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		0.1	□□□□□ -2.39
ARO9	P38840	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		0.08	□□□□□ -2.4
ARO9	P38840	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		0.06	□□□□□ -2.4
ARO9	P38840	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		0.03	□□□□□ -2.4
ARO9	P38840	snR47	snR47	99 nt		0.03	□□□□□ -2.4
ARO9	P38840	snR62	snR62	100 nt		0	□□□□□ -2.41
ARO9	P38840	RPL41A	YDL184C	78 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
ARO9	P38840	snR45	snR45	172 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
ARO9	P38840	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
ARO9	P38840	YDL247W-A	YDL247W-A	75 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
ARO9	P38840	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
ARO9	P38840	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
ARO9	P38840	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
ARO9	P38840	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
ARO9	P38840	SKI7	YOR076C	2244 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
ARO9	P38840	YLL066W-B	YLL066W-B	171 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
ARO9	P38840	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
ARO9	P38840	snR38	snR38	95 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
ARO9	P38840	YKL225W	YKL225W	348 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
ARO9	P38840	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
ARO9	P38840	snR64	snR64	101 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
ARO9	P38840	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
ARO9	P38840	snR161	snR161	161 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
ARO9	P38840	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
ARO9	P38840	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
ARO9	P38840	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
ARO9	P38840	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
ARO9	P38840	snR53	snR53	91 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
ARO9	P38840	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
ARO9	P38840	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
ARO9	P38840	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-0.72	□□□□□ -2.52

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