Protein–RNA interactions for Protein: P38746

YLF2, Obg-like ATPase homolog, yeastyeast

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLF2P38746 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.47□□□□□ -2.33
YLF2P38746 YNL170WYNL170W 396 nt0.46□□□□□ -2.34
YLF2P38746 YNL205CYNL205C 423 nt0.46□□□□□ -2.34
YLF2P38746 BIR1YJR089W 2865 nt0.45□□□□□ -2.34
YLF2P38746 ATP8Q0080 147 nt0.45□□□□□ -2.34
YLF2P38746 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.44□□□□□ -2.34
YLF2P38746 YBR099CYBR099C 384 nt0.44□□□□□ -2.34
YLF2P38746 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.43□□□□□ -2.34
YLF2P38746 YMR160WYMR160W 2451 nt0.43□□□□□ -2.34
YLF2P38746 PMP2YEL017C-A 132 nt0.4□□□□□ -2.35
YLF2P38746 EST1YLR233C 2100 nt0.4□□□□□ -2.35
YLF2P38746 Q0092Q0092 141 nt0.39□□□□□ -2.35
YLF2P38746 STF2YGR008C 255 nt0.39□□□□□ -2.35
YLF2P38746 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.39□□□□□ -2.35
YLF2P38746 IQG1YPL242C 4488 nt0.37□□□□□ -2.35
YLF2P38746 UTP20YBL004W 7482 nt0.37□□□□□ -2.35
YLF2P38746 snR69snR69 101 nt0.37□□□□□ -2.35
YLF2P38746 MLP2YIL149C 5040 nt0.36□□□□□ -2.35
YLF2P38746 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.36□□□□□ -2.35
YLF2P38746 FMP27YLR454W 7887 nt0.34□□□□□ -2.35
YLF2P38746 SEC10YLR166C 2616 nt0.34□□□□□ -2.36
YLF2P38746 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.33□□□□□ -2.36
YLF2P38746 YNL266WYNL266W 420 nt0.33□□□□□ -2.36
YLF2P38746 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.3□□□□□ -2.36
YLF2P38746 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.29□□□□□ -2.36
YLF2P38746 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.28□□□□□ -2.36
YLF2P38746 YBR178WYBR178W 375 nt0.28□□□□□ -2.36
YLF2P38746 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.27□□□□□ -2.37
YLF2P38746 RDS3YPR094W 324 nt0.27□□□□□ -2.37
YLF2P38746 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.26□□□□□ -2.37
YLF2P38746 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.26□□□□□ -2.37
YLF2P38746 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.26□□□□□ -2.37
YLF2P38746 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.26□□□□□ -2.37
YLF2P38746 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.26□□□□□ -2.37
YLF2P38746 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.26□□□□□ -2.37
YLF2P38746 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.26□□□□□ -2.37
YLF2P38746 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.26□□□□□ -2.37
YLF2P38746 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.26□□□□□ -2.37
YLF2P38746 ESP1YGR098C 4893 nt0.24□□□□□ -2.37
YLF2P38746 AI1Q0050 2505 nt0.23□□□□□ -2.37
YLF2P38746 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.22□□□□□ -2.37
YLF2P38746 SOV1YMR066W 2697 nt0.21□□□□□ -2.38
YLF2P38746 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.17□□□□□ -2.38
YLF2P38746 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.16□□□□□ -2.38
YLF2P38746 YOL014WYOL014W 375 nt0.13□□□□□ -2.39
YLF2P38746 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.12□□□□□ -2.39
YLF2P38746 snR128snR128 126 nt0.12□□□□□ -2.39
YLF2P38746 snR50snR50 90 nt0.11□□□□□ -2.39
YLF2P38746 THO2YNL139C 4794 nt0.09□□□□□ -2.39
YLF2P38746 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.08□□□□□ -2.4
YLF2P38746 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.04□□□□□ -2.4
YLF2P38746 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.01□□□□□ -2.41
YLF2P38746 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.02□□□□□ -2.41
YLF2P38746 Q0143Q0143 153 nt-0.03□□□□□ -2.41
YLF2P38746 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.03□□□□□ -2.41
YLF2P38746 snR61snR61 90 nt-0.06□□□□□ -2.42
YLF2P38746 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.07□□□□□ -2.42
YLF2P38746 snR81snR81 201 nt-0.08□□□□□ -2.42
YLF2P38746 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.08□□□□□ -2.42
YLF2P38746 snR67snR67 82 nt-0.1□□□□□ -2.43
YLF2P38746 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.1□□□□□ -2.43
YLF2P38746 snR45snR45 172 nt-0.11□□□□□ -2.43
YLF2P38746 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.12□□□□□ -2.43
YLF2P38746 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.16□□□□□ -2.44
YLF2P38746 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.17□□□□□ -2.44
YLF2P38746 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.17□□□□□ -2.44
YLF2P38746 snR85snR85 171 nt-0.2□□□□□ -2.44
YLF2P38746 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.2□□□□□ -2.44
YLF2P38746 SBH2YER019C-A 267 nt-0.22□□□□□ -2.44
YLF2P38746 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.27□□□□□ -2.45
YLF2P38746 SKI7YOR076C 2244 nt-0.29□□□□□ -2.46
YLF2P38746 snR47snR47 99 nt-0.3□□□□□ -2.46
YLF2P38746 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.31□□□□□ -2.46
YLF2P38746 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.32□□□□□ -2.46
YLF2P38746 YMR326CYMR326C 309 nt-0.34□□□□□ -2.46
YLF2P38746 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.35□□□□□ -2.47
YLF2P38746 RPL41AYDL184C 78 nt-0.37□□□□□ -2.47
YLF2P38746 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.39□□□□□ -2.47
YLF2P38746 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.43□□□□□ -2.48
YLF2P38746 YHR217CYHR217C 462 nt-0.44□□□□□ -2.48
YLF2P38746 YBL109WYBL109W 336 nt-0.45□□□□□ -2.48
YLF2P38746 snR62snR62 100 nt-0.47□□□□□ -2.48
YLF2P38746 snR38snR38 95 nt-0.47□□□□□ -2.48
YLF2P38746 URB1YKL014C 5295 nt-0.47□□□□□ -2.48
YLF2P38746 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.5□□□□□ -2.49
YLF2P38746 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.58□□□□□ -2.5
YLF2P38746 YKL225WYKL225W 348 nt-0.6□□□□□ -2.51
YLF2P38746 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.63□□□□□ -2.51
YLF2P38746 snR161snR161 161 nt-0.63□□□□□ -2.51
YLF2P38746 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.63□□□□□ -2.51
YLF2P38746 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.66□□□□□ -2.52
YLF2P38746 snR33snR33 183 nt-0.68□□□□□ -2.52
YLF2P38746 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.72□□□□□ -2.52
YLF2P38746 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
YLF2P38746 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
YLF2P38746 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
YLF2P38746 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-0.83□□□□□ -2.54
YLF2P38746 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.83□□□□□ -2.54
YLF2P38746 snR64snR64 101 nt-0.85□□□□□ -2.55
YLF2P38746 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.87□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.2 ms