Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	RCO1	YMR075W	2055 nt		0.29	□□□□□ -2.36
ATG12	P38316	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		0.28	□□□□□ -2.36
ATG12	P38316	YOR170W	YOR170W	306 nt		0.27	□□□□□ -2.37
ATG12	P38316	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		0.26	□□□□□ -2.37
ATG12	P38316	ESP1	YGR098C	4893 nt		0.25	□□□□□ -2.37
ATG12	P38316	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		0.25	□□□□□ -2.37
ATG12	P38316	YOR102W	YOR102W	351 nt		0.25	□□□□□ -2.37
ATG12	P38316	CSE1	YGL238W	2883 nt		0.24	□□□□□ -2.37
ATG12	P38316	YNL337W	YNL337W	255 nt		0.24	□□□□□ -2.37
ATG12	P38316	snR48	snR48	113 nt		0.24	□□□□□ -2.37
ATG12	P38316	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		0.23	□□□□□ -2.37
ATG12	P38316	GLG1	YKR058W	1851 nt		0.22	□□□□□ -2.37
ATG12	P38316	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		0.2	□□□□□ -2.38
ATG12	P38316	YOR225W	YOR225W	330 nt		0.2	□□□□□ -2.38
ATG12	P38316	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		0.19	□□□□□ -2.38
ATG12	P38316	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		0.19	□□□□□ -2.38
ATG12	P38316	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		0.19	□□□□□ -2.38
ATG12	P38316	YOL013W-A	YOL013W-A	192 nt		0.18	□□□□□ -2.38
ATG12	P38316	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		0.17	□□□□□ -2.38
ATG12	P38316	YBR099C	YBR099C	384 nt		0.16	□□□□□ -2.38
ATG12	P38316	SOV1	YMR066W	2697 nt		0.16	□□□□□ -2.38
ATG12	P38316	EST1	YLR233C	2100 nt		0.16	□□□□□ -2.38
ATG12	P38316	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		0.14	□□□□□ -2.39
ATG12	P38316	YLR294C	YLR294C	330 nt		0.13	□□□□□ -2.39
ATG12	P38316	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		0.12	□□□□□ -2.39
ATG12	P38316	Q0032	Q0032	291 nt		0.11	□□□□□ -2.39
ATG12	P38316	snR69	snR69	101 nt		0.1	□□□□□ -2.39
ATG12	P38316	PMP2	YEL017C-A	132 nt		0.09	□□□□□ -2.4
ATG12	P38316	YGR164W	YGR164W	336 nt		0.08	□□□□□ -2.4
ATG12	P38316	YBR178W	YBR178W	375 nt		0.07	□□□□□ -2.4
ATG12	P38316	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		0.07	□□□□□ -2.4
ATG12	P38316	snR45	snR45	172 nt		0.06	□□□□□ -2.4
ATG12	P38316	SOM1	YEL059C-A	225 nt		0.05	□□□□□ -2.4
ATG12	P38316	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		0.05	□□□□□ -2.4
ATG12	P38316	YNL205C	YNL205C	423 nt		0.04	□□□□□ -2.4
ATG12	P38316	snR50	snR50	90 nt		0.04	□□□□□ -2.4
ATG12	P38316	SEC10	YLR166C	2616 nt		0.03	□□□□□ -2.4
ATG12	P38316	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		0.02	□□□□□ -2.41
ATG12	P38316	YNL266W	YNL266W	420 nt		0.02	□□□□□ -2.41
ATG12	P38316	snR128	snR128	126 nt		0.01	□□□□□ -2.41
ATG12	P38316	RDS3	YPR094W	324 nt		0	□□□□□ -2.41
ATG12	P38316	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
ATG12	P38316	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
ATG12	P38316	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
ATG12	P38316	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
ATG12	P38316	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
ATG12	P38316	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
ATG12	P38316	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
ATG12	P38316	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
ATG12	P38316	YNL170W	YNL170W	396 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
ATG12	P38316	ATP8	Q0080	147 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
ATG12	P38316	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
ATG12	P38316	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
ATG12	P38316	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
ATG12	P38316	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
ATG12	P38316	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
ATG12	P38316	SKI7	YOR076C	2244 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
ATG12	P38316	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
ATG12	P38316	snR67	snR67	82 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
ATG12	P38316	TFB5	YDR079C-A	219 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
ATG12	P38316	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
ATG12	P38316	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
ATG12	P38316	snR81	snR81	201 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
ATG12	P38316	Q0092	Q0092	141 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
ATG12	P38316	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
ATG12	P38316	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
ATG12	P38316	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
ATG12	P38316	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
ATG12	P38316	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
ATG12	P38316	snR47	snR47	99 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
ATG12	P38316	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
ATG12	P38316	snR61	snR61	90 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
ATG12	P38316	snR38	snR38	95 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
ATG12	P38316	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
ATG12	P38316	Q0143	Q0143	153 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
ATG12	P38316	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
ATG12	P38316	RPL41A	YDL184C	78 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
ATG12	P38316	snR161	snR161	161 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
ATG12	P38316	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
ATG12	P38316	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
ATG12	P38316	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
ATG12	P38316	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
ATG12	P38316	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
ATG12	P38316	snR85	snR85	171 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
ATG12	P38316	YKL225W	YKL225W	348 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
ATG12	P38316	YBL109W	YBL109W	336 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
ATG12	P38316	snR33	snR33	183 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
ATG12	P38316	snR62	snR62	100 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
ATG12	P38316	snR77	snR77	88 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
ATG12	P38316	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
ATG12	P38316	YMR326C	YMR326C	309 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
ATG12	P38316	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
ATG12	P38316	YHR217C	YHR217C	462 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
ATG12	P38316	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
ATG12	P38316	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
ATG12	P38316	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
ATG12	P38316	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
ATG12	P38316	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
ATG12	P38316	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
ATG12	P38316	YLL066W-B	YLL066W-B	171 nt		-0.66	□□□□□ -2.52

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