Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms