Protein–RNA interactions for Protein: P25375

PRD1, Saccharolysin, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1P25375 ESP1YGR098C 4893 nt0.26□□□□□ -2.37
PRD1P25375 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.24□□□□□ -2.37
PRD1P25375 YBR099CYBR099C 384 nt0.23□□□□□ -2.37
PRD1P25375 snR39BsnR39B 96 nt0.23□□□□□ -2.37
PRD1P25375 RPM2YML091C 3609 nt0.22□□□□□ -2.37
PRD1P25375 snR48snR48 113 nt0.22□□□□□ -2.37
PRD1P25375 YOR102WYOR102W 351 nt0.21□□□□□ -2.38
PRD1P25375 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.18□□□□□ -2.38
PRD1P25375 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.16□□□□□ -2.38
PRD1P25375 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.15□□□□□ -2.39
PRD1P25375 EST1YLR233C 2100 nt0.14□□□□□ -2.39
PRD1P25375 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.14□□□□□ -2.39
PRD1P25375 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.14□□□□□ -2.39
PRD1P25375 YNL198CYNL198C 303 nt0.14□□□□□ -2.39
PRD1P25375 YGR151CYGR151C 336 nt0.13□□□□□ -2.39
PRD1P25375 YNL337WYNL337W 255 nt0.13□□□□□ -2.39
PRD1P25375 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.12□□□□□ -2.39
PRD1P25375 SOV1YMR066W 2697 nt0.08□□□□□ -2.4
PRD1P25375 YBL053WYBL053W 375 nt0.07□□□□□ -2.4
PRD1P25375 THO2YNL139C 4794 nt0.05□□□□□ -2.4
PRD1P25375 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.05□□□□□ -2.4
PRD1P25375 snR128snR128 126 nt0.04□□□□□ -2.4
PRD1P25375 YNL338WYNL338W 159 nt0.03□□□□□ -2.4
PRD1P25375 snR69snR69 101 nt0.02□□□□□ -2.41
PRD1P25375 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.02□□□□□ -2.41
PRD1P25375 PMP2YEL017C-A 132 nt0.01□□□□□ -2.41
PRD1P25375 YNL205CYNL205C 423 nt0.01□□□□□ -2.41
PRD1P25375 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0□□□□□ -2.41
PRD1P25375 YGR164WYGR164W 336 nt-0.02□□□□□ -2.41
PRD1P25375 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.03□□□□□ -2.41
PRD1P25375 snR45snR45 172 nt-0.03□□□□□ -2.41
PRD1P25375 Q0032Q0032 291 nt-0.06□□□□□ -2.42
PRD1P25375 RDS3YPR094W 324 nt-0.07□□□□□ -2.42
PRD1P25375 SEC10YLR166C 2616 nt-0.1□□□□□ -2.42
PRD1P25375 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.11□□□□□ -2.43
PRD1P25375 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.12□□□□□ -2.43
PRD1P25375 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.12□□□□□ -2.43
PRD1P25375 YBR178WYBR178W 375 nt-0.14□□□□□ -2.43
PRD1P25375 YNL266WYNL266W 420 nt-0.17□□□□□ -2.44
PRD1P25375 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.18□□□□□ -2.44
PRD1P25375 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.19□□□□□ -2.44
PRD1P25375 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.21□□□□□ -2.44
PRD1P25375 snR50snR50 90 nt-0.21□□□□□ -2.44
PRD1P25375 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.22□□□□□ -2.44
PRD1P25375 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.23□□□□□ -2.45
PRD1P25375 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.23□□□□□ -2.45
PRD1P25375 SBH2YER019C-A 267 nt-0.24□□□□□ -2.45
PRD1P25375 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.29□□□□□ -2.46
PRD1P25375 YOR225WYOR225W 330 nt-0.29□□□□□ -2.46
PRD1P25375 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.29□□□□□ -2.46
PRD1P25375 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.3□□□□□ -2.46
PRD1P25375 YLR294CYLR294C 330 nt-0.32□□□□□ -2.46
PRD1P25375 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.32□□□□□ -2.46
PRD1P25375 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.33□□□□□ -2.46
PRD1P25375 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.37□□□□□ -2.47
PRD1P25375 snR67snR67 82 nt-0.39□□□□□ -2.47
PRD1P25375 URB1YKL014C 5295 nt-0.42□□□□□ -2.48
PRD1P25375 SKI7YOR076C 2244 nt-0.47□□□□□ -2.48
PRD1P25375 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.53□□□□□ -2.49
PRD1P25375 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.56□□□□□ -2.5
PRD1P25375 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.59□□□□□ -2.5
PRD1P25375 YNL170WYNL170W 396 nt-0.6□□□□□ -2.51
PRD1P25375 snR161snR161 161 nt-0.63□□□□□ -2.51
PRD1P25375 snR33snR33 183 nt-0.63□□□□□ -2.51
PRD1P25375 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.68□□□□□ -2.52
PRD1P25375 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.68□□□□□ -2.52
PRD1P25375 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.69□□□□□ -2.52
PRD1P25375 ATP8Q0080 147 nt-0.71□□□□□ -2.52
PRD1P25375 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
PRD1P25375 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
PRD1P25375 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
PRD1P25375 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.75□□□□□ -2.53
PRD1P25375 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.75□□□□□ -2.53
PRD1P25375 snR81snR81 201 nt-0.76□□□□□ -2.53
PRD1P25375 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.76□□□□□ -2.53
PRD1P25375 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.79□□□□□ -2.54
PRD1P25375 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.8□□□□□ -2.54
PRD1P25375 snR38snR38 95 nt-0.8□□□□□ -2.54
PRD1P25375 RPL41AYDL184C 78 nt-0.81□□□□□ -2.54
PRD1P25375 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
PRD1P25375 snR47snR47 99 nt-0.83□□□□□ -2.54
PRD1P25375 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.83□□□□□ -2.54
PRD1P25375 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.84□□□□□ -2.54
PRD1P25375 snR61snR61 90 nt-0.85□□□□□ -2.55
PRD1P25375 snR77snR77 88 nt-0.87□□□□□ -2.55
PRD1P25375 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.87□□□□□ -2.55
PRD1P25375 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.88□□□□□ -2.55
PRD1P25375 Q0092Q0092 141 nt-0.9□□□□□ -2.55
PRD1P25375 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.92□□□□□ -2.56
PRD1P25375 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.93□□□□□ -2.56
PRD1P25375 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.95□□□□□ -2.56
PRD1P25375 YKL225WYKL225W 348 nt-1.04□□□□□ -2.58
PRD1P25375 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.05□□□□□ -2.58
PRD1P25375 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.06□□□□□ -2.58
PRD1P25375 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.1□□□□□ -2.59
PRD1P25375 Q0143Q0143 153 nt-1.11□□□□□ -2.59
PRD1P25375 snR62snR62 100 nt-1.15□□□□□ -2.59
PRD1P25375 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.21□□□□□ -2.6
PRD1P25375 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.24□□□□□ -2.61
PRD1P25375 YNR077CYNR077C 255 nt-1.24□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms