Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbip1J3QMK2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms