Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms