Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vmn2r25W4VSP2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn2r25W4VSP2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn2r25W4VSP2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r25W4VSP2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn2r25W4VSP2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms