Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top3bQ9Z321 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top3bQ9Z321 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Top3bQ9Z321 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms