Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt16Q9Z2K1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt16Q9Z2K1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt16Q9Z2K1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt16Q9Z2K1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt16Q9Z2K1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt16Q9Z2K1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt16Q9Z2K1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt16Q9Z2K1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt16Q9Z2K1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt16Q9Z2K1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt16Q9Z2K1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt16Q9Z2K1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt16Q9Z2K1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.7 ms