Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Mbd3Q9Z2D8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Mbd3Q9Z2D8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Mbd3Q9Z2D8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Mbd3Q9Z2D8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Mbd3Q9Z2D8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Mbd3Q9Z2D8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Mbd3Q9Z2D8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Mbd3Q9Z2D8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Mbd3Q9Z2D8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Mbd3Q9Z2D8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Mbd3Q9Z2D8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Mbd3Q9Z2D8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Mbd3Q9Z2D8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Mbd3Q9Z2D8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Mbd3Q9Z2D8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Mbd3Q9Z2D8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mbd3Q9Z2D8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Mbd3Q9Z2D8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Mbd3Q9Z2D8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms