Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C8

Ybx2, Y-box-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx2Q9Z2C8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx2Q9Z2C8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ybx2Q9Z2C8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx2Q9Z2C8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx2Q9Z2C8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx2Q9Z2C8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx2Q9Z2C8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx2Q9Z2C8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx2Q9Z2C8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx2Q9Z2C8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx2Q9Z2C8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx2Q9Z2C8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx2Q9Z2C8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx2Q9Z2C8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ybx2Q9Z2C8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx2Q9Z2C8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms