Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn7Q9Z261 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn7Q9Z261 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn7Q9Z261 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn7Q9Z261 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn7Q9Z261 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn7Q9Z261 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn7Q9Z261 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn7Q9Z261 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn7Q9Z261 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn7Q9Z261 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn7Q9Z261 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn7Q9Z261 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn7Q9Z261 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn7Q9Z261 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn7Q9Z261 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn7Q9Z261 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn7Q9Z261 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms