Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx39bQ9Z1N5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx39bQ9Z1N5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms