Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfkbiaQ9Z1E3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbiaQ9Z1E3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfkbiaQ9Z1E3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NfkbiaQ9Z1E3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms