Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z125

Creb3l1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l1Q9Z125 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l1Q9Z125 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Creb3l1Q9Z125 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Creb3l1Q9Z125 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Creb3l1Q9Z125 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms