Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PapolbQ9WVP6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PapolbQ9WVP6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PapolbQ9WVP6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PapolbQ9WVP6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PapolbQ9WVP6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms