Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cyp46a1Q9WVK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cyp46a1Q9WVK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cyp46a1Q9WVK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cyp46a1Q9WVK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cyp46a1Q9WVK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cyp46a1Q9WVK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cyp46a1Q9WVK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cyp46a1Q9WVK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cyp46a1Q9WVK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp46a1Q9WVK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cyp46a1Q9WVK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cyp46a1Q9WVK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cyp46a1Q9WVK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cyp46a1Q9WVK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cyp46a1Q9WVK8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cyp46a1Q9WVK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms