Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carm1Q9WVG6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carm1Q9WVG6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Carm1Q9WVG6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Carm1Q9WVG6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carm1Q9WVG6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms