Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn3Q9WUK7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Opn3Q9WUK7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Opn3Q9WUK7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Opn3Q9WUK7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms