Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul1Q9WTX6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul1Q9WTX6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cul1Q9WTX6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul1Q9WTX6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul1Q9WTX6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms