Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkraQ9WTX2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkraQ9WTX2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkraQ9WTX2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkraQ9WTX2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkraQ9WTX2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkraQ9WTX2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkraQ9WTX2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkraQ9WTX2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrkraQ9WTX2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkraQ9WTX2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkraQ9WTX2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms