Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmed2Q9R0Q3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmed2Q9R0Q3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmed2Q9R0Q3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed2Q9R0Q3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed2Q9R0Q3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed2Q9R0Q3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed2Q9R0Q3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmed2Q9R0Q3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmed2Q9R0Q3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmed2Q9R0Q3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed2Q9R0Q3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmed2Q9R0Q3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms