Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf346Q9R0B7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf346Q9R0B7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf346Q9R0B7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf346Q9R0B7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf346Q9R0B7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf346Q9R0B7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf346Q9R0B7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf346Q9R0B7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf346Q9R0B7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf346Q9R0B7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf346Q9R0B7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf346Q9R0B7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf346Q9R0B7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms