Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ1

Afdn, Afadin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfdnQ9QZQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AfdnQ9QZQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AfdnQ9QZQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AfdnQ9QZQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AfdnQ9QZQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AfdnQ9QZQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AfdnQ9QZQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AfdnQ9QZQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
AfdnQ9QZQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AfdnQ9QZQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AfdnQ9QZQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AfdnQ9QZQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AfdnQ9QZQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AfdnQ9QZQ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AfdnQ9QZQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AfdnQ9QZQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AfdnQ9QZQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AfdnQ9QZQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AfdnQ9QZQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AfdnQ9QZQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms