Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChmlQ9QZD5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmlQ9QZD5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ChmlQ9QZD5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChmlQ9QZD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms