Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc4Q9QZD4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc4Q9QZD4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc4Q9QZD4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc4Q9QZD4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc4Q9QZD4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc4Q9QZD4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc4Q9QZD4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ercc4Q9QZD4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ercc4Q9QZD4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc4Q9QZD4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc4Q9QZD4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc4Q9QZD4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc4Q9QZD4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc4Q9QZD4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc4Q9QZD4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc4Q9QZD4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc4Q9QZD4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc4Q9QZD4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc4Q9QZD4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc4Q9QZD4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc4Q9QZD4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc4Q9QZD4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc4Q9QZD4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms