Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vnn3Q9QZ25 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vnn3Q9QZ25 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vnn3Q9QZ25 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vnn3Q9QZ25 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vnn3Q9QZ25 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vnn3Q9QZ25 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms