Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmeff2Q9QYM9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmeff2Q9QYM9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmeff2Q9QYM9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmeff2Q9QYM9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms