Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abt1Q9QYL7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abt1Q9QYL7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abt1Q9QYL7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abt1Q9QYL7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abt1Q9QYL7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abt1Q9QYL7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abt1Q9QYL7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abt1Q9QYL7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abt1Q9QYL7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abt1Q9QYL7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abt1Q9QYL7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abt1Q9QYL7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abt1Q9QYL7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abt1Q9QYL7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abt1Q9QYL7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abt1Q9QYL7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abt1Q9QYL7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abt1Q9QYL7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abt1Q9QYL7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms